जीवाणु पारिस्थितिकी को बैक्टीरिया और उनके पर्यावरण के बीच बातचीत के रूप में परिभाषित किया गया है। बैक्टीरिया जीवमंडल और कुछ प्रमुख प्रक्रियाओं में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं, जैसे मीथेन का उत्पादन और ऑक्सीकरण, मिट्टी का निर्माण, चट्टान का मिट्टी में रूपांतरण आदि।
बैक्टीरियल पारिस्थितिकी के संबंधित जर्नल
जर्नल ऑफ बैक्टीरियोलॉजी एंड पैरासिटोलॉजी, माइकोबैक्टीरियल डिजीज, जर्नल ऑफ प्रोबायोटिक्स एंड हेल्थ, जापानी जर्नल ऑफ बैक्टीरियोलॉजी, इंटरनेशनल जर्नल ऑफ माइकोबैक्टीरियोलॉजी, इंटरनेशनल जर्नल ऑफ लेप्रोसी एंड अदर माइकोबैक्टीरियल डिजीज, जर्नल ऑफ एंटीबैक्टीरियल एंड एंटीफंगल एजेंट्स।