क्लिनिकल माइक्रोबायोलॉजी संक्रामक रोग के एटियलॉजिकल एजेंटों के अध्ययन के लिए माइक्रोबायोलॉजिकल तकनीकों का अनुकूलन है। इसमें संक्रामक रोग की प्रकृति का पता लगाया जा सकता है और पृथक सूक्ष्मजीवों को रोकने या मारने के लिए विभिन्न एंटीबायोटिक दवाओं की क्षमता का परीक्षण किया जा सकता है। बैक्टीरिया, वायरस और परजीवी जैसे सूक्ष्मजीवों का आक्रमण और गुणन जो सामान्य रूप से शरीर के भीतर मौजूद नहीं होते हैं, संक्रमण कहलाते हैं।
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