जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

मानव डेंड्राइटिक कोशिकाओं में माइक्रो-आरएनए पर शेन्किफुझेंग इंजेक्शन (एसएफआई) के प्रभावों का अध्ययन करना

युवा एच, सेज डब्ल्यूएच, यिप डीएमवाई, चो एसपी, बूस्ट डब्ल्यूसीएस, झांग एमवी, फैन जेड, एनजी के, एनजी एमसीएच, येंग जेडब्ल्यूसी, हंग ए, एच डब्ल्यूएच, चोंग जीएसएल और ली आरएलपी

विधि: इस अध्ययन में 2-चरणीय दृष्टिकोण का उपयोग किया गया। सबसे पहले हम उन miRNA की पहचान करने के लिए एक मजबूत DC सेल लाइन का उपयोग कर रहे थे जो DC सक्रियण में शामिल हो सकते हैं; फिर मोनोसाइट-व्युत्पन्न DC का उपयोग करके पुष्टि की गई जो वास्तविक जीवन के शारीरिक संदर्भों के करीब थी। THP-1 सेल, एक मानव मोनोसाइटिक ल्यूकेमिया सेल लाइन, पहले DC के इन विट्रो अध्ययन के लिए उपयोगी साबित हुई है। इस अध्ययन में, हमने 381 ज्ञात मानव miRNAs (सेंगर miR बेस, संस्करण 14) के माइक्रोआरएनए सरणी का उपयोग करके SFI द्वारा सक्रिय DC में कई संभावित miRNA उम्मीदवारों की पहचान की। फिर miR-22, miR-107 और miR-200a को 30 से अधिक संभावित miRNA उम्मीदवारों में से चुना गया, जिनकी सापेक्ष अभिव्यक्ति गुना परिवर्तन >2 था, जिन्हें एनोटेशन डेटाबेस पाइपलाइन miR बेस में प्राप्त कम्प्यूटेशनल साक्ष्यों के अनुसार पहचाना गया था। वास्तविक समय आरटी-पीसीआर परिमाणीकरण द्वारा परिमाणीकरण के माध्यम से स्वस्थ सामान्य विषयों (n=7) के परिधीय रक्त मोनोन्यूक्लियर कोशिकाओं से मोनोसाइट-व्युत्पन्न डीसी (एमडीडीसी) का उपयोग करके एक पुष्टिकरण अध्ययन में अभिव्यक्ति में किसी भी बदलाव के लिए इन तीन miRNAs की आगे जांच की गई। इन परिणामों को फ्लो साइटोमेट्री का उपयोग करके MDDCs पर HLA-DR और CD80 के अभिव्यक्ति स्तरों के साथ सहसंबंधित किया गया था। परिणाम: पुष्टिकरण परिणामों ने सात MDDC नमूनों में SFI के कारण miR22, miR107 और miR-200a के अभिव्यक्तियों में कोई लगातार अप-विनियमन नहीं दिखाया। इसके अलावा, 24 घंटे के ऊष्मायन के लिए क्रमशः 1/20 और 1/40 के दो अलग-अलग कमजोर पड़ने में SFI के उपचार पर MDDC पर परीक्षण के परिणामों ने भी HLA-DR और CD80 (p>0.05) के महत्वहीन अभिव्यक्ति परिवर्तनों का प्रदर्शन किया। इसके अलावा, 1 घंटे के लिए 1/20 में पतला SFI, 4 घंटे के लिए 1/20 में पतला SFI, और 1 घंटे के लिए 1/40 में पतला SFI के उपचार के साथ MDDCs के लिए तीन mi-RNA की अभिव्यक्ति और HLA-DR और CD80 की सतह अभिव्यक्ति के स्तर का सहसंबंध सांख्यिकीय रूप से महत्वपूर्ण नहीं था (p>0.05)। निष्कर्ष: miR-22, miR-107 और miR-200a के miRNA की अभिव्यक्ति में वृद्धि केवल THP-1 की सेल लाइन में पाई गई, लेकिन सात मानव परिधीय रक्त नमूनों से MDDCs में लगातार दिखाई नहीं दी। इस प्रकार क्या ये तीन mi-RNAs DC पर SFI की प्रक्रिया के दौरान वास्तव में महत्वपूर्ण एपिजेनेटिक विनियामक थे, यह अज्ञात है; और कई प्रामाणिक DC स्रोतों का उपयोग करके भविष्य में और अधिक जांच की आवश्यकता होगी।