जर्नल ऑफ बायोमोलेक्यूलर रिसर्च एंड थेरेप्यूटिक्स

अमूर्त

मानव प्लाज्मा प्रोटिओम की चौड़ाई की तुलना कैंसर कोशिका रेखा और बैक्टीरिया से की गई

एंड्री वी लिसित्सा, एकातेरिना वी पोवेरेनाया, एलेना ए पोनोमारेंको और अलेक्जेंडर आई अर्चाकोव

संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण ने किसी दिए गए जीव में प्रोटीन-एनकोडिंग जीन की संख्या का पता लगाया है, जिसे आणविक जटिलता का पहला अनुमान माना जा सकता है। आरएनए स्प्लिसिंग, बहुरूपता, सहसंयोजक संशोधन और गिरावट जैसे पोस्ट-ट्रांसक्रिप्शनल और पोस्ट-ट्रांसलेशनल संशोधनों के कारण, विभिन्न प्रोटीन प्रजातियों (प्रोटिओम) की कुल संख्या प्रोटीन-एनकोडिंग जीन की संख्या से बहुत अधिक हो सकती है। 2-डी जेल वैद्युतकणसंचलन का उपयोग मानव प्रोटिओम की चौड़ाई का अनुमान लगाने के लिए किया जा सकता है। विभिन्न प्रोटीन लोडिंग स्थितियों के तहत विभिन्न दागों (रंगों) के साथ प्राप्त स्पॉट की संख्या नमूने में विभिन्न प्रोटीन की संख्या का एक मोटा अनुमान दे सकती है। डाई संवेदनशीलता पर स्पॉट की संख्या की निर्भरता निर्धारित करने के लिए मानव प्लाज्मा और सेल लाइनों और जीवाणु कोशिकाओं पर डेटा की जांच की गई है। यह मानते हुए कि प्रत्येक स्पॉट एक अलग प्रोटीन प्रजाति का प्रतिनिधित्व करता है, स्पॉट-टू-सेंसिटिविटी निर्भरता को प्रोटिओम की चौड़ाई के अनुमान के रूप में लागू किया गया था। सिद्धांततः, 1 लीटर रक्त प्लाज्मा में 1.75 मिलियन प्रोटिओफॉर्म होते हैं, प्रत्येक हेपजी2 कोशिका में 18 हजार प्रजातियां होती हैं, तथा प्रत्येक जीवाणु में 6700 प्रजातियां होती हैं।