जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

अंतिम चरण के गुर्दे के रोग में IFN-γ, SOCS1 और SOCS3 प्रमोटर क्षेत्रों की मिथाइलेशन प्रोफ़ाइल

मैवेल घट्टास, फातमा अल-शारावी, नोहा मेस्बाह और दीना अबो-एलमाटी

अंतिम चरण की वृक्क बीमारी (ESRD) जीर्ण सूजन की स्थिति है। डीएनए मिथाइलेशन एक प्रमुख एपिजेनेटिक संशोधन है जिसमें जीन अभिव्यक्ति को शांत करने की क्षमता है। IFN-γ और साइटोकाइन सिग्नलिंग का दमन (SOCS) सूजन के आवश्यक मॉड्यूलेटर हैं। वर्तमान अध्ययन का उद्देश्य ESRD रोगियों और नियंत्रणों के परिधीय रक्त से अलग किए गए DNA में IFN-γ, SOCS1 और SOCS3 प्रमोटर क्षेत्रों की मिथाइलेशन स्थिति निर्धारित करना था, ताकि इस मिथाइलेशन स्थिति को ESRD की नैदानिक ​​विशेषताओं के साथ सहसंबंधित किया जा सके। अध्ययन में 96 ESRD रोगियों और 96 स्वस्थ जातीय, आयु और लिंग मिलान वाले नियंत्रणों को शामिल किया गया था। अध्ययन किए गए जीन के प्रमोटर मिथाइलेशन का मूल्यांकन मिथाइलेशन-विशिष्ट पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन (MSP) का उपयोग करके किया गया था। हमारे अधिकांश नमूने IFN-γ प्रमोटर मिथाइलेशन के लिए सकारात्मक थे। पूर्ण अनमेथिलेशन केवल ESRD समूह (7.3%) में देखा गया था, और समूहों के बीच सांख्यिकीय अंतर देखा गया था (P=0.02)। IFN-γ अनमेथिलेशन अनुमानित ग्लोमेरुलर निस्पंदन दर (eGFR) में कमी और सीरम क्रिएटिनिन और कुल कोलेस्ट्रॉल दोनों स्तरों में वृद्धि से जुड़ा था। SOCS1 प्रमोटर मिथाइलेशन के लिए, आंशिक और पूर्ण मिथाइलेशन केवल ESRD रोगियों (क्रमशः 5.2% और 2.1%) में देखा गया था; हालाँकि नियंत्रण में कोई मिथाइलेशन नहीं पाया गया (P=0.014)। SOCS3 प्रमोटर मिथाइलेशन का पता न तो रोगी में और न ही नियंत्रण समूह में लगाया गया। निष्कर्ष में, IFN-γ और SOCS1 प्रमोटर क्षेत्रों की मिथाइलेशन प्रोफ़ाइल ESRD के रोगजनन में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाती है। वर्तमान अध्ययन रोग की प्रगति में एपिजेनेटिक्स की भूमिका पर प्रकाश डालता है।