जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

एमटीडीएनए हाइपरवेरिएबल क्षेत्र में उच्चतम उत्परिवर्तन और संक्रमण तीव्रता मैट्रिक्स के माध्यम से उत्परिवर्तन की पहचान निर्धारित करने में न्यूक्लियोटाइड बेस एक्स टी-एन के साथ बायोस्टैटिस्टिक्स का अनुप्रयोग

पालित ईआईवाई और न्गीली वाई

जैविक साक्ष्य के माध्यम से अपराध के पीड़ितों या संदिग्धों की फोरेंसिक पहचान के क्षेत्र में मानव माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए (एमटीडीएनए) का गहन उपयोग किया गया है। एक एकल कोशिका में एमटीडीएनए अणुओं की संख्या हजारों में होती है जो बहुत कम या क्षतिग्रस्त नमूनों का विश्लेषण करने में सक्षम बनाती है। अभी तक प्राकृतिक आपदाओं, युद्धों और दुर्घटनाओं जैसे बड़े पैमाने पर आपदा पीड़ितों में एमटीडीएनए का उपयोग करके पहचान के लिए कोई मानक तरीका नहीं है, जिससे पहचान प्रक्रिया तेजी से नहीं चल पाती है। इस अध्ययन में एमटीडीएनए अनुक्रमों में C16.223t वेरिएंट पाए गए हैं जिनका उपयोग डेटाबेस को दो समूहों में विभाजित करने के लिए किया जा सकता है ताकि गणितीय एल्गोरिदम के माध्यम से पहचान की प्रक्रिया को तेज किया जा सके। इस वेरिएंट में 91 पॉलीमॉर्फिक मानव एमटीडीएनए एचवीएस1 के साथ 300 न्यूक्लियोटाइड (16,024-16,324) की उच्चतम आवृत्ति (29.7%) है जो एनसीबीआई डेटाबेस से 142 अनुक्रमों के रूप में प्राप्त की गई है। डेटा संग्रह पापुआन मानव एमटीडीएनए समूहों से प्राप्त एमटीडीएनए अनुक्रम जो एनसीबीआई में प्रकाशित हुए हैं। अनुक्रम में एक पंक्ति में क्लासिफायर के रूप में इस्तेमाल किया जा सकने वाला अगला वेरिएंट 16,311; 16,304; 16,189; और 16,270 है जिसकी पहचान (T→c) है। एक मैट्रिक्स के लिए Q प्रतिवर्ती है इसलिए मैट्रिक्स और में विपरीत विकर्ण हो सकते हैं। इस प्रकार उपरोक्त समीकरण को विकर्ण विधि का उपयोग करके हल किया जा सकता है जिसे लिखा जा सकता है: ܳ = ܵ רܵ െ1 । यह समीकरण एमटीडीएनए के न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम में होने वाले संक्रमणों और अनुप्रस्थ प्रतिस्थापन उत्परिवर्तनों की संख्या की गणना कर सकता है। इस समूहीकरण के साथ, नमूनों की पहचान की प्रक्रिया को तेज करने के लिए डेटाबेस को कम किया जा सकता है। उच्चतम आवृत्ति के साथ वेरिएंट द्वारा समूहीकरण की अपेक्षित विधि को फोरेंसिक रुचि जैसे पुलिस या एमटीडीएनए डेटाबेस अध्ययन नृविज्ञान और विकासवादी जीव विज्ञान के प्रयोजनों के लिए संहिताकरण डेटाबेस में विकसित किया जा सकता है।