जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

शहतूत के पूर्ण माइटोकॉन्ड्रियल जीनोम अनुक्रम भिन्नता और फाइलोजेनेटिक विश्लेषण

गुओ लियानग्लिआंग, शि यिसु, वू मेंगमेंग, माइकल अक्का, कियांग लिन, वेइगुओ झाओ*

पृष्ठभूमि: शहतूत आर्थिक रूप से महत्वपूर्ण फसल है, जो विभिन्न पर्यावरणीय परिस्थितियों के प्रति सहनशील है। पौधे (पत्तियों) का उपयोग रेशमकीट को खिलाने और भूनिर्माण के लिए किया जाता है और इसमें उच्च विकास की संभावनाएं और वैज्ञानिक अनुसंधान मूल्य हैं। माइटोकॉन्ड्रिया पौधों का पावरहाउस है जो जीवन प्रक्रियाओं को पूरा करने के लिए आवश्यक ऊर्जा का उत्पादन करता है।

उद्देश्य: पौधों में जीवन प्रक्रियाओं को पूरा करने के लिए आवश्यक ऊर्जा का उत्पादन करने वाले पावरहाउस के रूप में प्लांट माइटोकॉन्ड्रिया (एमटी) जीनोम काम करता है। हालाँकि, शहतूत के पौधे के माइटोकॉन्ड्रिया (एमटी) जीनोम का अभी भी पता नहीं लगाया जा सका है। इस अध्ययन में मोरस एल ( एम. एट्रोपुरपुरिया और एम. मल्टीकॉलिस ) के एमटी जीनोम की जांच की गई और इसकी तुलना अन्य पौधों की प्रजातियों से की गई।

विधियाँ: मोरस एल ( एम. एट्रोपुरपुरिया और एम. मल्टीकॉलिस ) के एमटी जीनोम को ऑक्सफोर्ड नैनोपोर प्रोमेथ आयन का उपयोग करके अनुक्रमित किया गया और डेटा को इकट्ठा करके उसका विश्लेषण किया गया और फिर अन्य पौधों के माइटोकॉन्ड्रियन जीनोम से तुलना की गई। अध्ययन किए गए शहतूत के पौधों की विकास स्थिति का अध्ययन करने के लिए फ़ाइलोजेनेटिक विश्लेषण किया गया।

परिणाम: एम. मल्टीकॉलिस के गोलाकार एमटी जीनोम की लंबाई 361,546 बीपी है, इसमें 54 जीन शामिल हैं, जिनमें 31 प्रोटीन-कोडिंग जीन, 20 टीआरएनए जीन और 3 आरआरएनए जीन शामिल हैं और इसमें ए (27.38%), टी (27.20%), सी (22.63%) और जी (22.79%) की संरचना है। दूसरी ओर, एम. एट्रोपुरपुरिया के गोलाकार एमटी जीनोम की लंबाई 395,412 बीपी है, इसमें सी+जी (45.50%) शामिल है, जिसमें 2 आरआरएनए जीन, 22 टीआरएनए जीन और 32 पीसीजी वाले 57 कार्यात्मक जीन शामिल हैं। एम. मल्टीकॉलिस और एम . एट्रोपुरपुरिया एमटी जीनोम में अनुक्रम दोहराव, आरएनए संपादन जीन और सीपी से एमटी में माइग्रेशन मौजूद है ।

मोरस और अन्य 28 प्रजातियों के सम्पूर्ण एमटी जीनोम पर आधारित फाइलोजेनेटिक विश्लेषण सटीक विकासवादी और वर्गीकरण स्थिति को दर्शाता है।

निष्कर्ष: हमने पाया कि मोरस प्रजाति का एमटी जीनोम गोलाकार है, जिसमें एम. मल्टीकॉलिस की लंबाई 361,546 बीपी है। 54 जीन, जिनमें 31 प्रोटीन-कोडिंग जीन, 20 टीआरएनए जीन और 3 आरआरएनए जीन शामिल हैं। इसके अलावा, एम. एट्रोपुरपुरिया की लंबाई 395,412 बीपी पाई गई। इसके अलावा, कुल 57 जीन में 32 प्रोटीन-कोडिंग जीन, 22 टीआरएनए और 3 आरआरएनए शामिल हैं, जिन्हें जीनोम में एनोटेट किया गया था। परिणाम मोरस एमटी जीनोम की व्यापक समझ प्रदान करेंगे और भविष्य के अध्ययनों और शहतूत की किस्मों के प्रजनन में मदद कर सकते हैं।