क्लिनिकल एवं मेडिकल बायोकैमिस्ट्री

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टेट्रासल्फाइड ब्रिज (टीटीएसबी) गठन: एचआईवी-1 के जीपी120 अणु की वास्तुकला और गतिशीलता में एक असाधारण मध्यवर्ती संरचना

हैरी एफ. क्रेवेकोयर

CD4+ कोशिकाओं में HIV विषाणु के प्रवेश को अंजाम देने वाले अणुओं में से एक Gp120 में कई एलोस्टेरिक डाइसल्फ़ाइड ब्रिज होते हैं। इस अध्ययन में हम 3-डी कॉन्फ़िगरेशन (क्रिस्टलोग्राफी पर आधारित) और विभिन्न gp120 क्रिस्टल के UNSW DBA विश्लेषणों में इन संभावित डाइसल्फ़ाइड (डाइसल्फ़ाइड) ब्रिज की गतिशीलता का पता लगाते हैं। डेटा एक टेट्रासल्फ़ाइड (टेट्रासल्फ़ाइड) ब्रिज (TTSB) के अस्तित्व को प्रकट करता है, जो एक डाइसल्फ़ाइड ब्रिज के साथ मिलकर gp120 की वास्तुकला में दो लंबवत बीटा शीट (अर्थात V3 और V4) को रखता है जबकि एलोस्टेरिक बॉन्ड के बीच ऊर्जा के सुरक्षित हस्तांतरण की अनुमति देता है। कई gp120 क्रिस्टल के विश्लेषण से पता चलता है कि TTSB एक स्थिर लैंडमार्क के बजाय एक मध्यवर्ती के रूप में अधिक है, जो केवल संरचनात्मक विशेषताओं की तुलना में अधिक जटिल कार्यों को दर्शाता है। यह TTSB, जो gp120 के विभिन्न क्रिस्टलों में, HIV-1 के विभिन्न उपभेदों और क्लेड्स में देखा जाता है, विभिन्न रेंडरिंग सॉफ़्टवेयर द्वारा प्रदर्शित किया जाता है और कुछ को UNSW डाइसल्फ़ाइड बॉन्ड एनालिसिस (DBA) इंजन द्वारा भी पता लगाया, रिपोर्ट किया और विशेषता दी जाती है। यह टेट्रासल्फ़ाइड ब्रिज एलोस्टेरिक बॉन्ड Cys296-Cys331 को Cys385-Cys418 से जोड़ता है, कभी-कभी CYS331:SG-CYS385:SG के रूप में, और कभी-कभी CYS331:SG-CYS418:SG के रूप में। इसके अलावा क्रिस्टल 3TIH, 4LSR और 4R4N में, हमने TTSB की एक मध्यवर्ती अवस्था भी देखी, जहाँ यह एक त्रिकोणीय गठन प्रस्तुत करता है जिसमें सल्फर परमाणु CYS331: SG एक साथ CYS385:SG और CYS418:SG दोनों से जुड़ता है, जो gp120 अणु की कार्यात्मक गतिशीलता में एक महत्वपूर्ण मध्यवर्ती का प्रतिनिधित्व करता है। इस असाधारण संरचना (TTSB) की उपस्थिति बहुक्रियाशील डिज़ाइन और यांत्रिकी के साथ-साथ gp120 अणु की कुछ जटिल कमज़ोरियों में कुछ दिलचस्प अंतर्दृष्टि की ओर इशारा करती है, जो एंटीवायरल थेरेपी के लिए एक नया लक्ष्य उजागर करती है।