फार्माकोजेनोमिक्स और फार्माकोप्रोटिओमिक्स जर्नल

अमूर्त

मेथेनोपाइरस कैंडलेरी AV19 के पूर्ण जीनोम में सेलेनोसिस्टीन tRNA के दमनकारी रूप

उत्तम रॉयमंडल, शिब शंकर दास, रिया रक्षित और सत्यब्रत साहू4*

आर्किया में, पिछले अध्ययनों ने कई इंट्रॉन-युक्त tRNAs और विभाजित tRNAs की उपस्थिति का खुलासा किया है। आर्किया में विभिन्न प्रकार के विघटित tRNA जीनों की उपस्थिति के कारण, आर्कियल tRNA जीनों का पूर्ण अप्रकाशित विश्लेषण जैव सूचना विज्ञान के क्षेत्र में एक चुनौतीपूर्ण कार्य बना हुआ है। यहाँ हमने एक कम्प्यूटेशनल विधि का सुझाव दिया है जो गायब tRNAs के दमनकारी वेरिएंट उत्पन्न करने के लिए tRNA के आधे हिस्सों को एन्कोड करने वाले व्यापक रूप से अलग किए गए जीन की खोज करता है। जीनोम में व्यापक रूप से अलग किए गए विभाजित tRNA जीनों के अस्तित्व को ध्यान में रखते हुए, हमने ऐसे अलग किए गए tRNA जीनों की भविष्यवाणी करने के लिए अपना tRNA खोज एल्गोरिदम विकसित किया है, जो कि क्लोवरलीफ़ भविष्यवाणी के आधार पर विभाजित परिकल्पना के साथ सहमति में tRNA के संरक्षित टर्मिनल 5'- और 3'-मोटिफ़ दोनों की खोज करके और स्प्लिस साइट्स पर बल्ज-हेलिक्स-बल्ज सेकेंडरी स्ट्रक्चर के सटीक सिलिको निर्धारण के आधार पर किया गया है। लापता टीआरएनए जीन की व्यापक खोज के द्वारा, हमने सेलेनोसिस्टीन टीआरएनए के नए वेरिएंट की पहचान की, जो मेथेनोपाइरस कैंडलेरी एवी19 में डाले गए थे। एम. कैंडलेरी एवी19 के संपूर्ण जीनोम अनुक्रम के विश्लेषण से सेलेनोसिस्टीन (सेक) को पढ़ने के लिए यूजीए को डिकोड करने वाले एक गैर-कोडिंग आरएनए के प्रतिलेखन के कई तरीके का पता चला और बाधित टीआरएनए जीन 002ई के आगे के अध्ययन का सुझाव दिया।