जर्नल ऑफ़ प्लांट पैथोलॉजी एंड माइक्रोबायोलॉजी

अमूर्त

लूप-मध्यस्थ आइसोथर्मल प्रवर्धन द्वारा क्लेबसिएला वेरीकोला और के. ऑक्सीटोका का विशिष्ट पता लगाना

जारेड यासुहारा-बेल, कालेब अयिन, अप्रैल हतादा, योंगहून यू, रॉबर्ट एल. श्लब और ऐनी एम. अल्वारेज़

क्लेबसिएला एसपीपी नैदानिक, पशु चिकित्सा और पौधे से जुड़े अलगाव के साथ अवसरवादी रोगजनक हैं। पिछले अध्ययन से पता चला है कि गुआम में गंभीर रूप से खराब हो चुके आयरनवुड पेड़ों की गीली लकड़ी से जीवाणु रिसाव में राल्स्टोनिया सोलानेसीरम , क्लेबसिएला वेरिकोला और के. ऑक्सीटोका शामिल थे। इस अध्ययन में, लूप-मीडिएटेड आइसोथर्मल एम्पलीफिकेशन (एलएएमपी) ने प्रत्येक जीव के लिए व्यक्तिगत रूप से डिज़ाइन किए गए अनूठे प्राइमर सेट का उपयोग करके विशेष रूप से के. वेरिकोला और के. ऑक्सीटोका का पता लगाया। प्रत्येक एलएएमपी ने अपने लक्ष्य का विशेष रूप से पता लगाया, जबकि गैर-लक्ष्य बैक्टीरिया और नकारात्मक नियंत्रण के लिए नकारात्मक परिणाम दिखाए। एलएएमपी ने टीका लगाए गए आयरनवुड स्टेम ऊतकों और जीवाणु रिसाव में क्लेबसिएला का पता लगाया। कुचले हुए पौधों के नमूनों का उपयोग करते समय प्राप्त होने वाले झूठे नकारात्मक परिणामों को प्लेटिंग और 12-घंटे के ऊष्मायन से जुड़े संवर्धन चरण को शामिल करके समाप्त किया गया। DGGE (डिनेचुरिंग ग्रेडिएंट जेल इलेक्ट्रोफोरेसिस) और एक क्लेबसिएला-विशिष्ट एंटीबॉडी का उपयोग करके एक कॉलोनी-ब्लॉट इम्यूनोसे ने भी टीका लगाए गए आयरनवुड में क्लेबसिएला का पता लगाया। DGGE बैंड और निकट से संबंधित एंटरोबैक्टर से एंटीबॉडी क्रॉस-रिएक्शन ने झूठे सकारात्मक परिणामों की संभावना को दिखाया। LAMP की प्रकृति इसे पॉइंट-ऑफ-केयर परीक्षण के लिए आदर्श बनाती है, और जब इस अध्ययन में विकसित LAMP प्राइमरों की विशिष्टता के साथ जोड़ा जाता है, तो यह गुआम में आयरनवुड में क्लेबसिएला के लिए एक नियमित क्षेत्र परीक्षण के रूप में इसकी क्षमता को प्रदर्शित करता है, साथ ही क्लेबसिएला संक्रमण के नैदानिक ​​और पशु चिकित्सा निदान भी करता है। इसके अतिरिक्त, इस अध्ययन में पता लगाने के लिए लक्षित क्षेत्रों का आणविक-आधारित निदान के सभी रूपों में अनुप्रयोग है।