जीन प्रौद्योगिकी

अमूर्त

sdRNA: एक कुशल और लक्ष्य-जीन विशिष्ट RNA हस्तक्षेप के लिए DNA बीज के साथ siRNA

कुमिको उई-तेई

आरएनए हस्तक्षेप (आरएनएआई), एक प्रक्रिया जिसके माध्यम से छोटे हस्तक्षेप करने वाले आरएनए (siRNAs) अनुक्रम-विशिष्ट पोस्ट-ट्रांसक्रिप्शनल जीन साइलेंसिंग को प्रेरित करते हैं, को आमतौर पर न केवल कार्यात्मक जीनोमिक्स के लिए बल्कि चिकित्सीय अनुप्रयोगों के लिए भी एक शक्तिशाली उपकरण के रूप में पहचाना जाता है। सटीक लक्ष्य जीन फ़ंक्शन और सफल चिकित्सीय अनुप्रयोगों को प्राप्त करने के लिए, एक कुशल और लक्ष्य जीन-विशिष्ट का चयन करना आवश्यक है

न्यूनतम ऑफ-टारगेट प्रभाव वाले siRNA। हमने पाया कि अनपेक्षित जीन पर ऑफ-टारगेट प्रभाव उत्पन्न करने की क्षमता बीज क्षेत्र (siRNA गाइड स्ट्रैंड के 5\' छोर से 2-8 स्थान) और लक्ष्य mRNA के बीच बनने वाले डुप्लेक्स की थर्मोडायनामिक स्थिरता से दृढ़ता से संबंधित है। इस गुण के अनुरूप, हमने पाया कि गाइड स्ट्रैंड के 5\' समीपस्थ आठ न्यूक्लियोटाइड में डीऑक्सीराइबोन्यूक्लियोटाइड और पैसेंजर स्ट्रैंड में पूरक न्यूक्लियोटाइड के साथ DNA-RNA काइमेरिक siRNA (chiRNA) ने बीज-लक्ष्य बेस-युग्मन में DNA-RNA डुप्लेक्स की कम स्थिरता के कारण वस्तुतः कोई ऑफ-टारगेट प्रभाव नहीं डाला। हालाँकि, प्राथमिक लक्ष्य जीन के लिए संबंधित RNAi गतिविधियाँ भी DNA प्रतिस्थापन द्वारा औसतन एक-दसवें हिस्से तक कम हो गईं। यहां, हम रिपोर्ट करते हैं कि विशेष रूप से बीज क्षेत्र (एसडीआरएनए) में सात डीऑक्सीराइबोन्यूक्लियोटाइड्स वाले siRNAs कुशल लक्ष्य-विशिष्टता प्रदर्शित कर सकते हैं, लेकिन ऑफ-टारगेट प्रभाव-कम RNAi गतिविधि प्रदर्शित कर सकते हैं।