जर्नल ऑफ़ प्लांट पैथोलॉजी एंड माइक्रोबायोलॉजी

अमूर्त

ल्यूटेओवायरस और पीएवी-बार्ले येलो ड्वार्फ वायरस का संबंध

होदा एमए वज़ीरी*, हला ए अमीन, केई साकर, एएम सोलिमन

मिस्र में उगाए गए गेहूँ के पौधों से पृथक किए गए जौ के पीले बौने वायरस (BYDV-PAV) की विशेषता बताई गई है। ओपन रीडिंग फ़्रेम (ORF1) में स्थित पॉलीमरेज़ जीन (P1) और ओपन रीडिंग फ़्रेम (ORF3) में स्थित कोट प्रोटीन जीन (CP) के लिए जौ के पीले बौने वायरस (BYDV-PAV) के दो कोडिंग क्षेत्रों को लक्षित किया गया था। जेनबैंक में BYDV-PAV आइसोलेट के अनुसार दो विशिष्ट प्राइमरों को डिज़ाइन किया गया था। BYDV-PAV के मिस्र के एक आइसोलेट के ORF1 और ORF3 के DNA अंशों को क्लोन किया गया और अनुक्रमित किया गया। अनुक्रम में वायरल पॉलीमरेज़ जीन (P1) के लिए एक पूर्ण लंबाई वाला ORF1 कोडिंग शामिल था। इसमें 910 नॉट की लंबाई शामिल है जो 34.67 के M(r) के साथ 303 अमीनो एसिड की एक अनुमानित पॉलीपेप्टाइड श्रृंखला को एनकोड करती है। दूसरी ओर, वायरल कोट प्रोटीन के लिए ORF3 कोडिंग के अनुक्रम डेटा से पता चला कि यह 603 बीपी लंबाई का था और 21.96 केडीए के आणविक भार के साथ एक अनुमानित प्रोटीन 200 अमीनो एसिड को एनकोड करता है। हालांकि, NCBI जेनबैंक में उपलब्ध आइसोलेट्स के साथ मिस्र के आइसोलेट ईजी-डब्ल्यूजेड के कई अनुक्रम संरेखण पर आधारित फ़ाइलोजेनेटिक होमोलॉजी ट्री ने खुलासा किया कि पॉलीमरेज़ जीन (P1) ने क्रमशः 05GG2, PAV 014 और PAV014, PAV-Aus आइसोलेट्स के साथ अमीनो एसिड और न्यूक्लियोटाइड स्तरों पर 76.5%-99% और 71.6%-93.2% अनुक्रम पहचान साझा की। दूसरी ओर, कोट प्रोटीन जीन (सीपी) ने अमीनो एसिड और न्यूक्लियोटाइड स्तर पर दो आइसोलेट्स 06KM14 और 05GG2 के साथ क्रमशः 85.1% -99.5% और 89.7% -99.2% अनुक्रम समानता दिखाई।