जीन प्रौद्योगिकी

अमूर्त

ट्रांसक्रिप्शनल जीन सक्रियण या ट्रांसक्रिप्शनल जीन साइलेंसिंग द्वारा एंडोथेलियल कोशिकाओं में वीईजीएफ-ए अभिव्यक्ति का विनियमन: जीनोम वाइड ट्रांसक्रिप्शनल प्रतिक्रिया का विश्लेषण

तिया हुस्सो, मिक्को पी. तुरुनेन और सेप्पो येला-हर्टटुआला

वैस्कुलर एंडोथेलियल ग्रोथ फैक्टर (VEGF-A) कई बीमारियों में एक महत्वपूर्ण जीन है, जैसे कि कैंसर और हृदय संबंधी रोग। हमने म्यूरिन एंडोथेलियल कोशिकाओं में जीनोम-वाइड जीन अभिव्यक्ति पैटर्न में परिवर्तनों की जांच की, जब VEGF-A की अभिव्यक्ति को प्रमोटर लक्षित छोटे हेयरपिन RNAs (shRNAs) का उपयोग करके एपिजेनेटिक रूप से संशोधित किया गया था। म्यूरिन एंडोथेलियल कोशिकाओं को shRNAs व्यक्त करने वाले लेंटिवायरल वेक्टर के साथ ट्रांसड्यूस किया गया था जो जीन प्रमोटर के पूरक हैं। VEGF-A को ऊपर और नीचे विनियमित करने के कारण जीनोम-वाइड mRNA अभिव्यक्ति परिवर्तनों की जांच करने के लिए जीन अभिव्यक्ति सरणी प्रयोग किए गए थे। लागू सांख्यिकीय मानदंडों के अनुसार कई सैकड़ों अलग-अलग व्यक्त जीन थे। हमने देखा कि VEGF-A को कम करने के प्रभाव VEGF-A के अपरेगुलेशन के प्रभावों की तुलना में बहुत अधिक व्यापक थे। हमारे सिलिको विश्लेषण से पता चला कि VEGF-A अभिव्यक्ति पर एपिजेनेटिक प्रभावों के कारण कई अलग-अलग जैविक प्रक्रियाएँ बदल जाती हैं। VEGF-A मध्यस्थता वाली ट्रांसक्रिप्शनल प्रतिक्रिया के मुख्य विनियामकों में से एक ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर ATF-4 पाया गया। यह एंडोथेलियल कोशिकाओं में VEGF-A अभिव्यक्ति के एपिजेनेटिक संशोधन के लिए ट्रांसक्रिप्शनल प्रतिक्रिया को दर्शाने वाला पहला अध्ययन है। एपिजेनेटिक जीन विनियमन एक प्राकृतिक जीन विनियामक तंत्र का प्रतिनिधित्व करता है और ये परिणाम एंडोथेलियल कोशिकाओं में VEGF-A विनियमन के पहले से अज्ञात निहितार्थों को प्रकट करते हैं।