जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

रैपिड एट्रियल पेसिंग वाले बीगल कुत्तों में एट्रियल मांसपेशियों के ऊर्जा चयापचय पर बाएं एट्रियल उपांग रिसेक्शन के प्रभाव का प्रोटिओमिक्स अध्ययन

चांग जिंग, ज़िंग यू, ना लिन, कुई वेन्जिंग, यू टिंग, ज़ू ज़िन

उद्देश्य: एट्रियल फ़िब्रिलेशन (AF) के दौरान मायोकार्डियल ऊर्जा चयापचय एक शोध हॉटस्पॉट है। प्रोटिओमिक्स एट्रियल फ़िब्रिलेशन के अध्ययन के लिए एक नई विधि प्रदान करता है; हालाँकि, एट्रियल मांसपेशी के ऊर्जा चयापचय पर बाएं एट्रियल उपांग (LAA) के प्रभाव के कोई संबंधित अध्ययन नहीं हैं। हम तेजी से एट्रियल पेसिंग वाले बीगल कुत्तों में बाएं एट्रियल मायोकार्डियल कोशिकाओं के ऊर्जा चयापचय पर LAA के रिसेक्शन के प्रभाव का विश्लेषण करने के लिए प्रोटिओमिक्स का उपयोग करते हैं।

विधियाँ: नौ बीगल कुत्तों को तीन समूहों में विभाजित किया गया: मॉडल समूह (तेज़ आलिंद पेसिंग/एलएए रिसेक्शन), सकारात्मक नियंत्रण समूह (तेज़ आलिंद पेसिंग/एलएए संरक्षण), और नकारात्मक नियंत्रण समूह (साइनस लय)। बारह सप्ताह बाद, प्रोटिओमिक्स अध्ययन के लिए आलिंद ऊतकों को रिसेक्ट किया गया। लक्षित प्रोटिओमिक्स के सत्यापन के लिए समानांतर प्रतिक्रिया निगरानी (पीआरएम) का उपयोग किया गया।

परिणाम: प्रायोगिक बनाम सकारात्मक नियंत्रण समूह में 55 प्रोटीन ऊपर विनियमित थे और 68 प्रोटीन नीचे विनियमित थे। ग्लूकोज और लिपिड चयापचय से संबंधित प्रोटीन मुख्य रूप से नीचे विनियमित थे, और माइटोकॉन्ड्रिया से संबंधित प्रोटीन मुख्य रूप से साइनस लय की तुलना में तेजी से आलिंद पेसिंग के दौरान नीचे विनियमित थे। LAA के रिसेक्शन के बाद, ग्लूकोज-चयापचय से संबंधित प्रोटीन ने एक महत्वपूर्ण ऊपर विनियमन प्रवृत्ति दिखाई, लिपिड चयापचय से संबंधित प्रोटीन और भी नीचे विनियमित थे, जबकि माइटोकॉन्ड्रिया से संबंधित प्रोटीन LAA संरक्षण के साथ तेजी से आलिंद पेसिंग की तुलना में ऊपर विनियमित थे। PRM ने प्रोटिओमिक्स परिणामों की विश्वसनीयता की पुष्टि की।

निष्कर्ष: एएफ की स्थिति में, एलएए के उच्छेदन से माइटोकॉन्ड्रिया की मात्रा और कार्यों को प्रभावित करके ऊर्जा चयापचय संरचना पर अपेक्षाकृत बड़ा प्रभाव पड़ा।