जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

PICRUSt2 और पिफिलिन पाइपलाइनों का उपयोग करके भारत के प्राकृतिक रूप से किण्वित दूध उत्पादों में बैक्टीरिया की पूर्वानुमानित कार्यक्षमता

एच. नकीबाफर जोन्स शांगप्लियांग, ज्योति प्रकाश तमांग*

प्राकृतिक रूप से किण्वित दूध (NFM) उत्पाद भारतीय राज्यों सिक्किम और अरुणाचल प्रदेश में लोकप्रिय खाद्य व्यंजन हैं। भारत के इन NFM उत्पादों में जीवाणु समुदायों का पहले उच्च-थ्रूपुट अनुक्रम विधि द्वारा विश्लेषण किया गया था। हालांकि, भारत के NFM उत्पादों की भविष्य कहनेवाला जीन कार्यक्षमता का अध्ययन नहीं किया गया है। इस अध्ययन में, सिक्किम और अरुणाचल प्रदेश के NFM उत्पादों के कच्चे अनुक्रमों को MG-RAST/NCBI डेटाबेस सर्वर से एक्सेस किया गया था। माइक्रोबियल कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी का अध्ययन करने के लिए PICRUSt2 और Piphillin उपकरण लागू किए गए थे। MUSiCC- सामान्यीकृत KOs और PICRUSt2 और Piphillin दोनों से KEGG मार्गों को मैप करने के परिणामस्वरूप बाद की तुलना में पूर्व का प्रतिशत अधिक था। हालांकि, दोनों पाइपलाइनों से कार्यात्मक विशेषताओं की तुलना की गई