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संरचनात्मक वर्णमाला के माध्यम से प्रोटीन प्राथमिक अनुक्रम से रुचि के संरचनात्मक पैटर्न की भविष्यवाणी: एटीपी/जीटीपी बंधन स्थल की भविष्यवाणी का चित्रण

क्रिस्टेल रेयन्स, लेस्ली रेगड, रॉबर्ट सबेटियर और ऐनी-क्लाउड कैंप्रोक्स

जैविक कार्यों या संरचना से जुड़े विशेष संरचनात्मक रूपांकनों की भविष्यवाणी अत्यंत महत्वपूर्ण है। किसी भी संरचना संबंधी जानकारी के बिना प्राथमिक अनुक्रमों की बढ़ती उपलब्धता को देखते हुए, अमीनो-एसिड (AA) अनुक्रमों से भविष्यवाणियाँ आवश्यक हैं। संरचनात्मक रूपांकनों की प्रस्तावित भविष्यवाणी विधि एक संरचनात्मक वर्णमाला पर आधारित दो-चरणीय दृष्टिकोण है। यह वर्णमाला किसी भी 3D संरचना को संरचनात्मक अक्षरों (SL) के 1D अनुक्रम में एनकोड करने की अनुमति देती है। सबसे पहले, आनुवंशिक प्रोग्रामिंग के माध्यम से AA और SL के बीच बुनियादी पत्राचार नियमों को सीखा जाता है। फिर, रुचि के प्रत्येक पहले से पहचाने गए रूपांकन के लिए एक छिपा हुआ मार्कोव मॉडल सीखा जाता है। अंत में, किसी भी दिए गए अमीनो-एसिड अनुक्रम के लिए दिए गए 3D रूपांकन के अनुरूप होने की संभावना प्रदान की जाती है। एक शास्त्रीय फ़ंक्शन के लिए हमारी विधि की दक्षता की तुलना अन्य लोगों से करने के लिए विधि को ATP बाइंडिंग साइटों पर लागू किया जाता है। फिर, अधिक दुर्लभ रूप से पूर्वानुमानित फ़ंक्शन या अन्य प्रकार के रूपांकनों के अनुरूप रूपांकनों को सीखने की विधि की क्षमता को चित्रित किया गया है।

अस्वीकृति: इस सारांश का अनुवाद कृत्रिम बुद्धिमत्ता उपकरणों का उपयोग करके किया गया है और इसे अभी तक समीक्षा या सत्यापित नहीं किया गया है।