जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

H5N1 और H1N1 NS1 प्रोटीन के विरुद्ध माइक्रो आरएनए की भविष्यवाणी: अनुक्रम विशिष्ट चिकित्सीय विकास की एक खिड़की

पंकज कोपार्डे और शैलजा सिंह

प्रेरणा: इन्फ्लूएंजा एंटीजेनिक प्रोटीन की अत्यधिक परिवर्तनशील प्रकृति के कारण पारंपरिक इन्फ्लूएंजा दवाओं के परिणामस्वरूप कार्रवाई विफल हो सकती है। अनुक्रम विशिष्ट चिकित्सा की सिलिको भविष्यवाणी कम समय लेने वाली और लागत प्रभावी है। अधिकांश miRNA लक्ष्य भविष्यवाणी प्लेटफ़ॉर्म उनकी विशिष्टता और भविष्यवाणी में संवेदनशीलता में भिन्न होते हैं। यहाँ हम एवियन इन्फ्लूएंजा H5N1 वायरस के गैर-संरचनात्मक प्रोटीन 1 और खंड 8 स्वाइन इन्फ्लूएंजा H1N1 वायरस के खिलाफ माइक्रो आरएनए की भविष्यवाणी करने के लिए एक जैव सूचना विज्ञान दृष्टिकोण का प्रस्ताव करते हैं।

परिणाम: hsa-miR-138, hsa-miR-525-5p और hsa-miR-124 को H5N1 वायरस के NS1 प्रोटीन के विरुद्ध संभावित अनुक्रम विशिष्ट चिकित्सीय एजेंट के रूप में चुना गया। विभिन्न H1N1 खंड 8 जीनोम पर इसी तरह के अध्ययनों के परिणामस्वरूप miRNAs की भविष्यवाणी हुई, जिनका उपयोग एंटी-इन्फ्लूएंजा एजेंट के रूप में किया जा सकता है। पूर्वानुमानित माइक्रो RNAs में मेजबान कोशिका की विनियामक प्रक्रियाओं, MAPK मार्ग, mTOR मार्ग सहित तनाव संबंधी मार्गों में भी भूमिका होती है और कैंसर से संबंधित मार्गों में शामिल पाए जाते हैं।