फार्माकोजेनोमिक्स और फार्माकोप्रोटिओमिक्स जर्नल

अमूर्त

द्वितीयक संरचना पूर्वानुमान कार्यक्रमों का उपयोग करके डायहाइड्रोपाइरीमिडीन डिहाइड्रोजनेज जीन (DPYD) बहुरूपता से संबंधित 5-फ्लूरोयूरेसिल विषाक्तता का पूर्वानुमान

क्योंघी सोन

5-फ्लूरोयूरेसिल (5-FU) को डायहाइड्रोपाइरीमिडीन डिहाइड्रोजनेज (DPD) द्वारा तेजी से विघटित किया जाता है, जो 5-FU और पाइरीमिडीन के अपचय पथ में पहला और दर-सीमित एंजाइम है। DPD-सामान्य रोगी के लिए 5-FU की एक सहनीय चिकित्सीय खुराक DPD-कमी वाले रोगी को असहनीय बना सकती है। दवाओं के लिए शरीर की प्रतिक्रिया और सहनशीलता में ये अंतर-व्यक्तिगत भिन्नताएं डायहाइड्रोपाइरीमिडीन डिहाइड्रोजनेज जीन (DPYD) सिंगल न्यूक्लियोटाइड पॉलीमॉर्फिज्म (SNPs) के अलावा अन्य के लिए जिम्मेदार हो सकती हैं। रोगी के जीवन और धन को बचाने के लिए, स्वास्थ्य पेशेवरों को नैदानिक ​​परीक्षणों या 5-FU थेरेपी से पहले 5-FU के प्रति रोगी की सहनशीलता का पता लगाने के लिए एक सुविधाजनक और विश्वसनीय तरीका चाहिए। यहाँ मैं द्वितीयक संरचना भविष्यवाणी कार्यक्रमों, YASPIN, PSIPRED और Jpred 3 का उपयोग करके 5-FU के प्रति किसी व्यक्ति की असहिष्णुता की भविष्यवाणी करने का एक सरल, आसान और तेज़ तरीका प्रस्तुत करता हूँ, जो किसी के लिए भी स्वतंत्र रूप से उपलब्ध है। ये कार्यक्रम DPYD के भीतर उत्परिवर्तन के साथ और उसके बिना DPD द्वितीयक संरचना की भविष्यवाणी करते हैं ताकि मानव DPD डोमेन के कार्यात्मक साइटों पर उत्परिवर्तन-प्रेरित संरचनात्मक परिवर्तनों के प्रभाव का अनुमान लगाया जा सके। नमूने के रूप में विश्लेषण किए गए 11 SNP में, DPD डोमेन V में दो मिसेंस उत्परिवर्तन, D949V (SNP A2846T) और C953S (SNP G2858C), [4Fe-4S] क्लस्टर के लिए जिम्मेदार डोमेन कोर के विघटन का कारण बनने का अनुमान है। इसके अलावा, DPYD में एक स्प्लिसिंग क्षेत्र (In 14 G1A) में एक बिंदु उत्परिवर्तन से काटे गए DPD mRNAs (एक्सॉन 14 स्किपिंग) और निष्क्रिय DPD प्रोटीन (D581 से N635 तक 55 अमीनो एसिड गायब) का उत्पादन होने का अनुमान है, जो DPD गतिविधि का पूर्ण नुकसान का कारण बनता है। इस प्रकार, इन द्वितीयक संरचना पूर्वानुमान कार्यक्रमों द्वारा की गई भविष्यवाणी, DPYD में उत्परिवर्तन के कारण 5-FU से जुड़ी विषाक्तता के बारे में उपयोगी और विश्वसनीय जानकारी प्रदान करती है।