जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

टेगेनेरिया एग्रेस्टिस (होबो स्पाइडर) के पैरालिटिक कीटनाशक विष (आईटीएक्स-1) की 3डी संरचना की भविष्यवाणी

ए.जी.इंगेल और एन.जे.चिखले

पैरालिटिक कीटनाशक विष (आईटीएक्स-1) (टेगेनेरिया एग्रेस्टिस) में संक्रमण से मेजबान की रक्षा करने के लिए प्रतिरक्षा प्रणाली को निर्देशित और सशक्त बनाने के लिए कई एंटीजेनिक घटक शामिल थे। अपने रिसेप्टर्स के लिए नैनोमोलर समानता वाले स्पाइडर पेप्टाइड टॉक्सिन आयन चैनलों की शारीरिक भूमिका को समझने और आयन चैनल से संबंधित बीमारियों के लिए नए चिकित्सीय एजेंटों और रणनीतियों के विकास के लिए आशाजनक औषधीय उपकरण हैं। टेगेनेरिया एग्रेस्टिस (होबो स्पाइडर) के पैरालिटिक कीटनाशक विष (आईटीएक्स-1) के लिए एक 3-आयामी मॉडल (3डी) विकसित किया गया था। संरचना की भविष्यवाणी के लिए एक होमोलॉजी मॉडलिंग विधि का उपयोग किया गया था। मॉडलिंग के लिए, mGenTHERADER द्वारा एक टेम्पलेट प्रोटीन प्राप्त किया गया था, अर्थात क्लोस्ट्रीडियम एसिड्यूरिसी के फेरेडॉक्सिन (1FCA) की उच्च-रिज़ॉल्यूशन एक्स-रे क्रिस्टलोग्राफी संरचना। टेम्पलेट प्रोटीन की तुलना करके MODELLER का उपयोग करके लक्ष्य प्रोटीन के लिए एक मोटा मॉडल बनाया गया था, जो तुलनात्मक मॉडलिंग के लिए एक कार्यक्रम है। मॉडल को प्रोटीन संरचना जाँच उपकरणों जैसे कि PROCHECK और WHAT IF का उपयोग करके विश्वसनीयता के लिए मान्य किया गया था। इस प्रकार चर्चा की गई जानकारी पैरालिटिक कीटनाशक विष (टेगेनेरिया एग्रेस्टिस) की आणविक समझ के लिए अंतर्दृष्टि प्रदान करती है। पूर्वानुमानित 3-डी मॉडल का उपयोग गीली प्रयोगशाला में प्रोटीन की विशेषता निर्धारित करने में किया जा सकता है।