जर्नल ऑफ़ प्लांट पैथोलॉजी एंड माइक्रोबायोलॉजी

अमूर्त

पॉलीमरेज़ और कोट प्रोटीन जेन को गेहूं के पीले बौने वायरस में लक्षित और विशेषता दी गई, निकाले गए अमीनो एसिड की तुलना जेनबैंक में समूह के सदस्यों के साथ की गई

होदा वज़िरी*

मिस्र में उगाए गए गेहूं के पौधों में वायरस जैसे लक्षण दिखाई देते हैं। RT-PCR तकनीक का उपयोग करके गेहूं के पीले बौने वायरस (WYDV-PAV) के दो कोडिंग क्षेत्रों को ओपन रीडिंग फ्रेम (ORF1) में स्थित पॉलीमरेज़ जीन (P1) और ओपन रीडिंग फ्रेम (ORF3) में स्थित कोट प्रोटीन जीन के लिए लक्षित किया गया था।
जेनबैंक में BYDV-PAV आइसोलेट के अनुसार विशिष्ट प्राइमरों के दो सेट डिज़ाइन किए गए थे। BYDV-PAV के मिस्र के एक आइसोलेट के ORF1 और ORF3 के डीएनए टुकड़ों को क्लोन किया गया और अनुक्रमित किया गया। अनुक्रम में वायरल पॉलीमरेज़ जीन के लिए कोडिंग करने वाला एक पूर्ण लंबाई वाला ORF1 शामिल था। इसमें 910 nt लंबाई शामिल है जो 34.67 के M(r) के साथ 303 अमीनो एसिड की एक अनुमानित पॉलीपेप्टाइड श्रृंखला को एनकोड करता है। दूसरी ओर, वायरल कोट प्रोटीन के लिए ORF3 कोडिंग के अनुक्रम डेटा से पता चला कि यह लंबाई में 603 बीपी था जो एक अनुमानित प्रोटीन 200 अमीनो एसिड को एन्कोड करता है, जिसका आणविक भार 21.96 केडीए है। हालांकि, NCBI जेनबैंक में उपलब्ध आइसोलेट्स के साथ मिस्र के आइसोलेट Egy-Wz के कई अनुक्रम संरेखण के आधार पर फ़ायलोजेनेटिक होमोलॉजी ट्री से पता चला है कि पॉलीमरेज़ जीन ने क्रमशः 05GG2, PAV 014 और PAV014, PAV-Aus आइसोलेट्स के साथ अमीनो एसिड और न्यूक्लियोटाइड स्तरों पर 76.5% -99% और 71.6% -93.2% अनुक्रम पहचान साझा की है।