जीवविज्ञान और चिकित्सा

अमूर्त

यूबिक्विटिन संयुग्मन (E2) एंजाइमों का फाइलोजेनी पुनर्निर्माण

मुहम्मद खान, कैसर जमील

पिछले कुछ वर्षों में जीन-ऑर्डर डेटा से फाइलोजेनी पुनर्निर्माण ने जीवविज्ञानियों और कंप्यूटर वैज्ञानिकों का बहुत ध्यान आकर्षित किया है। यूबिक्विटिन यूकेरियोट्स में व्यापक रूप से पाया जाता है और कोशिकाओं में चयनात्मक एटीपी-निर्भर प्रोटीन विघटन में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। यह कई प्रकार के कैंसर में भी अत्यधिक व्यक्त होता है। इसलिए, यूकेरिया में इसके विविधीकरण को समझने के लिए हमने विभिन्न कम्प्यूटेशनल विधियों का उपयोग करके इसके फाइलोजेनी को निर्धारित करने के लिए यह अध्ययन किया। यूबिक्विटिन संयुग्मन एंजाइम के सभी अनुक्रम प्रोटीन डेटा बैंक (PDB) से निकाले गए थे, और PHYML में कार्यान्वित अधिकतम संभावना विधि का उपयोग करके और बिना जड़ वाले फाइलोजेनेटिक पेड़ का निर्माण किया गया था। इस पेड़ में चार प्रमुख क्लस्टर और एक छोटा क्लस्टर था। हमने प्रोटीन अनुक्रम विकास में कार्यात्मक महत्व के साइट-विशिष्ट परिवर्तन से जीन के समूहों के लिए विचलन की गणना की। फिर विचलन को RASMOL का उपयोग करके PDB डेटा बैंक: (IL7K) से प्राप्त ube2c प्रोटीन की 3-D संरचना पर मैप किया गया। इस अध्ययन से, हम निष्कर्ष निकालते हैं कि हम उन सटीक साइटों को इंगित करने में सक्षम हैं जहाँ E2s का सक्रिय विकास हो रहा है और यह स्पष्ट है कि ये साइटें एक मजबूत शुद्धिकरण चयन के अधीन हैं। हम अनुमान लगाते हैं कि इस जानकारी का नियोप्लासिया में कुछ उपयोगी प्रभाव होगा क्योंकि ऐसी रिपोर्टें हैं कि इस प्रोटीन में उत्परिवर्तन ट्यूमर की प्रगति को बढ़ावा देने की संभावना है।