जर्नल ऑफ बैक्टीरियोलॉजी एंड पैरासिटोलॉजी

अमूर्त

अल-कुट/वासीट प्रांत/इराक में स्वस्थ नर और मादाओं से प्रमुख मलीय एस्चेरिचिया कोली पृथक्करण का फीलोजेनेटिक समूहन

सरिया एमजी अल-मायाही, अला एएम अल-खफाजी, नुहा एएस दोश, एसेल आरके अल-रेकाबी और अहलम जीएन अल-अताबी

एस्चेरिचिया कोली के फेकल आइसोलेट्स को चार मुख्य फ़ायलोजेनेटिक समूहों में विभाजित किया गया है जिन्हें A, B1, B2 और D नामित किया गया है। अधिकांश सहभोजी उपभेद समूह A से संबंधित हैं और इनमें अतिरिक्त आंत्र रोगजनक ई. कोली उपभेदों (ExPEC) की तुलना में कम विषाणु कारक होते हैं। यह अध्ययन मुख्य रूप से पीसीआर-आधारित प्रोटोकॉल का उपयोग करके अल-कुट शहर/वासीट प्रांत/इराक में स्वस्थ नर और मादाओं से सहभोजी फेकल ई. कोली आइसोलेट्स के फ़ायलोजेनेटिक समूहीकरण के लिए डिज़ाइन किया गया था। साथ ही इन आइसोलेट्स में ExPEC के विषाणु जीन का पता लगाया गया। इस अध्ययन में शामिल आइसोलेट्स (n=205) में, समूह A महिलाओं और पुरुषों दोनों के आइसोलेट्स में सबसे आम था (क्रमशः 68.5% बनाम 63.0%), उसके बाद समूह: B1 (क्रमशः 15.7% बनाम 22.6%), D (क्रमशः 10.7% बनाम 9.5%), और B2 (क्रमशः 4.1% बनाम 4.7%)। फ़ायलोजेनेटिक समूहों के लिंग वितरण ने महिलाओं और पुरुषों के बीच नगण्य अंतर दिखाया। महिलाओं और पुरुषों के आइसोलेट्स में पता लगाए गए सभी ExPEC के विषाणु जीनों के लिए महत्वपूर्ण रूप से अंतर नहीं था, सिवाय papC के जो कि महिलाओं के आइसोलेट्स (6.6%) की तुलना में पुरुषों के आइसोलेट्स (16.6%) में महत्वपूर्ण रूप से (P ≤ 0.05) अधिक प्रचलित था। महिलाओं और पुरुषों दोनों के अलगाव में सबसे अधिक प्रचलित विषाणु जीन fimH (क्रमशः 97.5% बनाम 100%) और iucC (क्रमशः 52.0% बनाम 55.9%) थे, जबकि सबसे कम प्रचलित sfa/foc (प्रत्येक 0%) और hly (क्रमशः 0.82% बनाम 0%) थे। इसके अलावा, विषाणु जीन समूह B2 में क्लस्टर किए गए अलगावों में केंद्रित थे। महिलाओं और
पुरुषों दोनों में, अल-कुट शहर में इराकी लोगों से प्रमुख सहभोजी फेकल ई. कोली अलगावों का उच्च प्रतिशत फ़ाइलोग्रुप ए में समूहीकृत हुआ, उसके बाद समूह B1 और D थे जबकि समूह B2 दुर्लभ था। इसके अलावा, ExPEC विशेषताओं वाले प्रमुख फेकल उपभेद बहुत कम प्रचलित थे।