जर्नल ऑफ़ प्लांट पैथोलॉजी एंड माइक्रोबायोलॉजी

अमूर्त

रेप-पीसीआर और मल्टीलोकस सीक्वेंस विश्लेषण के आधार पर ज़ैंथोमोनस कैम्पेस्ट्रिस पीवी कैम्पेस्ट्रिस रेस का रोगजनक और आनुवंशिक लक्षण वर्णन

प्रियंका सिंह राठौड़, दिनेश सिंह, ऋचा रघुवंशी और यादव डीके

ज़ैंथोमोनस कैम्पेस्ट्रिस पीवी. कैम्पेस्ट्रिस (पैमेल) डॉसन (Xcc) दुनिया भर में क्रूसिफ़र्स की काली सड़न बीमारी का कारक है। प्रजातियों के वितरण पैटर्न और जनसंख्या की विविधता को निर्धारित करने के लिए भारत के 12 कृषि-जलवायु क्षेत्रों से Xcc के पचहत्तर अलग-अलग नमूने एकत्र किए गए। सात मानक विभेदक क्रूसिफ़र्स पर रोगजनक प्रतिक्रिया के आधार पर, प्रजाति 1, 4 और 6 प्रचलित पाई गईं। रोगजनक विविधता का आकलन करने के लिए, सात ब्रैसिका और कोनो प्रजातियों वाले क्रूसिफ़र्स की 41 किस्मों को क्षेत्र की स्थितियों के तहत कृत्रिम रूप से टीका लगाया गया। ब्रैसिका जंसिया किस्में (पूसा बोल्ड, वरुण, पूसा विजय, पूसा मस्टर्ड 21 और पूसा मस्टर्ड 25) ने Xcc के सभी प्रकारों के प्रति प्रतिरोधक क्षमता दिखाई, जबकि ब्रैसिका ओलेरेशिया किस्म पूसा अगेती को प्रजाति 1 और 4 के प्रति प्रतिरोधक पाया गया। Xcc के इन 75 प्रकारों का आनुवंशिक लक्षण वर्णन रेप-पीसीआर (ईआरआईसी, आरईपी और बॉक्सपीसीआर) का उपयोग करके किया गया, जिसके बाद फ़ाइलोजेनेटिक विश्लेषण किया गया। Xcc के प्रकारों को 50% समानता गुणांक पर 6 समूहों में समूहीकृत किया गया और इन समूहों में से, प्रजाति 1, 4 और 6 से संबंधित Xcc के 28 प्रकारों को समूह 5 के अंतर्गत एक साथ समूहीकृत किया गया। बहुस्थानिक अनुक्रम विश्लेषण के लिए प्रजाति 1, 4 और 6 का प्रतिनिधित्व करने वाले पांच प्रकारों के 16S rRNA, hrpF और efP जीन के अनुक्रमों का उपयोग किया गया। 16एस आरआरएनए और एचआरपीएफ जीन के अनुक्रम विश्लेषण के आधार पर, भारतीय उपभेदों को उपभेद एक्ससीसी एटीसीसी 33913 (रेस 3, यूके) से बहुत निकट से संबंधित पाया गया, जबकि ईएफपी अनुक्रमों के आधार पर, वे उपभेदों रेस 1 एक्ससीसी बी100 (इटली) और रेस 9 एक्ससीसी 8004 (यूके) से निकट से संबंधित पाए गए।