जैवसमतुल्यता एवं जैवउपलब्धता जर्नल

अमूर्त

आणविक डॉकिंग की प्रगति और विकास पर विस्तृत समीक्षा

किरण रमेशभाई दुधात

संरचनात्मक आणविक जीव विज्ञान और कंप्यूटर-सहायता प्राप्त दवा निर्माण में, आणविक डॉकिंग एक महत्वपूर्ण उपकरण है। ज्ञात त्रि-आयामी संरचना वाले प्रोटीन के साथ लिगैंड के प्रचलित बंधन मोड की भविष्यवाणी करना लिगैंड-प्रोटीन डॉकिंग का उद्देश्य है। प्रभावी डॉकिंग विधियाँ एक स्कोरिंग सिस्टम का उपयोग करती हैं जो उम्मीदवार डॉकिंग को सही ढंग से रैंक करती है और उच्च-आयामी स्थानों का कुशलतापूर्वक पता लगाती है। यौगिकों के विशाल पुस्तकालयों पर आभासी स्क्रीनिंग करने, परिणामों को रेट करने और लिगैंड्स लक्ष्य को कैसे बाधित करते हैं, इसके लिए संरचनात्मक विचार प्रदान करने के लिए डॉकिंग के उपयोग से लीड ऑप्टिमाइज़ेशन को बहुत लाभ होता है। स्टोकेस्टिक खोज विधियों के निष्कर्षों की व्याख्या करना मुश्किल हो सकता है, और डॉकिंग के लिए इनपुट संरचनाओं को स्थापित करना उतना ही महत्वपूर्ण है जितना कि डॉकिंग स्वयं।

हाल के वर्षों में, कंप्यूटर-सहायता प्राप्त दवा डिजाइन ने बंधन आत्मीयता का अनुमान लगाने और इंटरैक्टिव मोड का आकलन करने के लिए आणविक डॉकिंग तकनीक पर बहुत अधिक भरोसा किया है क्योंकि यह दक्षता में उल्लेखनीय वृद्धि कर सकता है और अनुसंधान लागत को कम कर सकता है। इस कार्य में मुख्य अवधारणाएँ, तकनीकें और अक्सर उपयोग किए जाने वाले आणविक डॉकिंग अनुप्रयोगों का परिचय दिया गया है। इसके अतिरिक्त, यह सबसे लोकप्रिय डॉकिंग अनुप्रयोगों के बीच तुलना करता है और प्रासंगिक अध्ययन क्षेत्रों का सुझाव देता है। अंत में, एकीकृत तकनीक और गहन शिक्षण सहित आणविक डॉकिंग में हाल के विकास का एक संक्षिप्त सारांश प्रदान किया गया है। अपर्याप्त आणविक संरचना और स्कोरिंग तंत्र की अपर्याप्तता के कारण वर्तमान डॉकिंग अनुप्रयोग बंधन आत्मीयता का पूर्वानुमान लगाने के लिए पर्याप्त सटीक नहीं हैं।