जर्नल ऑफ़ स्टेम सेल रिसर्च एंड थेरेपी

अमूर्त

मेसेनकाइमल स्ट्रोमल कोशिकाएं और संवहनी मॉर्फोजेनेसिस: जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल और बढ़ावा देने वाले मार्ग

रॉजियर टीए वैन विज्क

सार
उद्देश्य: हेमटोपोइएटिक कोशिकाएँ और मेसेनकाइमल स्ट्रोमल कोशिकाएँ
भ्रूण कोशिका विभेदन वंश में एंडोथेलियल कोशिकाओं से निकटता से संबंधित हैं। संवहनी प्रतिरक्षा विज्ञान और संवहनी रूपजनन में सूक्ष्म वातावरण के रोगविज्ञान का अध्ययन करने के लिए , हमने इम्यूनोलॉजिकल जीनोम प्रोजेक्ट (ImmGen) से अभिव्यक्ति डेटा में मनुष्यों और चूहों
में संवहनी विसंगतियों में शामिल होने वाले आनुवंशिक कारकों का विश्लेषण किया। विधियाँ: हमने संवहनी तंत्र से संबंधित जीन सूची बनाने के लिए मानव डेटाबेस में अज्ञात विकृतियों और NCBI ऑनलाइन मेंडेलियन वंशानुक्रम के मानक सिंड्रोम की तस्वीरों का खनन किया। हमने ImmGen डेटाबेस में इन जीनों के अभिव्यक्ति हस्ताक्षरों का अध्ययन किया। Partek® Genomics Suite 6.6 का उपयोग करके पदानुक्रमित क्लस्टरिंग विश्लेषण किए गए। इसके बाद, अधिग्रहित क्लस्टरों की अलग-अलग जांच Ingenuity Pathway Analysis (IPA) के भीतर की गई। इन परिणामों के आधार पर हमने पेरीसाइट्स के साथ संबंध की जांच करने के लिए एक अलग डेटाबेस से पेरीसाइट्स के नमूनों के साथ एक प्रमुख घटक विश्लेषण (पीसीए) किया। परिणाम: हमारे डेटाबेस प्रश्नों के परिणामस्वरूप संवहनी तंत्र से संबंधित 438 जीनों की एक जीन सूची तैयार हुई, जिनमें से 384 का अध्ययन ImmGen डेटा सेट के भीतर किया जा सका। पदानुक्रमित क्लस्टरिंग के माध्यम से हमने पांच अलग-अलग क्लस्टरों की पहचान की जिनमें से एक मेसेंकाइमल कोशिका रेखाओं में अभिव्यक्ति के लिए विशिष्ट था। इसके बाद, आईपीए का उपयोग करके हमने पेरीसाइट्स कार्यों से संबंधित विभिन्न रास्ते खोजे । पेरीसाइट्स के नमूनों के साथ एक बाद के पीसीए ने मेसेंकाइमल मूल के विशिष्ट स्ट्रोमल कोशिकाओं से निकट समानता दिखाई, जो पेरीसाइट्स और इन कोशिका प्रकारों के बीच संवहनी जीनों के लिए साझा अभिव्यक्ति प्रोफाइल का संकेत देता है। निष्कर्ष: इस डेटा विश्लेषण अध्ययन में, हमने विभिन्न स्रोतों से डेटा संलयन किया, जो अध्ययन डिजाइन और कोशिका प्रकार के चयन में भविष्य के यांत्रिक और चिकित्सीय अध्ययनों में सहायता कर सकता है और साथ ही संवहनी विसंगतियों से संबंधित विशिष्ट रोग संबंधी आणविक तंत्रों के आधार पर चिकित्सीय लक्ष्यों को खोजने के लिए एक संभावित रणनीति प्रदान कर सकता है।