जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

स्तनधारी ग्लूटामिल एमिनोपेप्टिडेज़ जीन (ENPEP) और प्रोटीन: धमनी उच्च रक्तचाप में एक प्रमुख योगदानकर्ता का तुलनात्मक अध्ययन

रोजर एस होम्स, किम्बर्ली डी स्प्रैडलिंग-रीव्स और लॉरा ए कॉक्स

ग्लूटामिल एमिनोपेप्टिडेस (ENPEP) एंडोपेप्टिडेस के M1 परिवार का सदस्य है जो स्तनधारी प्रकार II इंटीग्रल मेम्ब्रेन जिंक युक्त एंडोपेप्टिडेस हैं। ENPEP रेनिनैंगियोटेंसिन प्रणाली के अपचय पथ में शामिल है जो एंजियोटेंसिन III बनाता है, जो रक्तचाप विनियमन और रक्त वाहिका निर्माण में भाग लेता है। कई स्तनधारी जीनोम परियोजनाओं से डेटा का उपयोग करके तुलनात्मक ENPEP अमीनो एसिड अनुक्रम और संरचनाओं और ENPEP जीन स्थानों की जांच की गई। स्तनधारी ENPEP अनुक्रमों ने 71-98% पहचान साझा की। सभी स्तनधारी ENPEP प्रोटीनों के लिए पाँच N-ग्लाइकोसिलेशन साइट संरक्षित की गईं, हालाँकि प्रत्येक मामले में 9-18 साइटें देखी गईं। अनुक्रम संरेखण, प्रमुख अमीनो एसिड अवशेष और अनुमानित द्वितीयक और तृतीयक संरचनाओं का भी अध्ययन किया गया, जिसमें ट्रांसमेम्ब्रेन और साइटोप्लाज्मिक अनुक्रम और सक्रिय साइट अवशेष शामिल हैं। मानव ENPEP अभिव्यक्ति के उच्चतम स्तर छोटी आंत के टर्मिनल इलियम और किडनी कॉर्टेक्स में देखे गए। स्तनधारी ENPEP जीन में 20 कोडिंग एक्सॉन थे। मानव ENPEP जीन प्रमोटर और पहले कोडिंग एक्सॉन में एक CpG द्वीप (CpG27) और कम से कम 6 ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर बाइंडिंग साइट्स थे, जबकि 3'-UTR क्षेत्र में 7 miRNA लक्ष्य साइट्स थे, जो शरीर के ऊतकों में ENPEP जीन अभिव्यक्ति के विनियमन में योगदान दे सकते हैं। तुलनात्मक उद्देश्यों के लिए चिकन ENPEP का उपयोग करके प्राइमेट, अन्य यूथेरियन, मार्सुपियल और मोनोट्रीम स्रोतों सहित स्तनधारी ENPEP जीन और प्रोटीन के संबंधों की फाइलोजेनेटिक विश्लेषणों ने जांच की।