जर्नल ऑफ़ प्लांट पैथोलॉजी एंड माइक्रोबायोलॉजी

अमूर्त

फाइटोफ्थोरा सिनामोमी में साइटोस्केलेटन निर्माण में शामिल एक्टिन1, एक्टिन2 और ट्यूबिलिन1 जीन का पृथक्करण और अनुक्रमण

इवोन एम मार्टिंस, एम कारमेन लोपेज़, एंजेल डोमिंग्वेज़ और अल्टिनो चौपिना

फाइटोफ्थोरा वंश के ऊमाइसीट्स कवक जैसे पौधे रोगजनक हैं जो कृषि और प्राकृतिक पारिस्थितिकी तंत्र के लिए विनाशकारी हैं। नॉर्डेस्ट ट्रांसमोंटानो क्षेत्र (उत्तर-पूर्व पुर्तगाल) में, कैस्टेनिया सैटिवा चेस्टनट संस्कृति अत्यंत महत्वपूर्ण है। सबसे बड़ी उत्पादकता और उपज में गिरावट फाइटोफ्थोरा सिनामोमी के कारण होने वाली स्याही रोग के कारण होती है जो कि सबसे व्यापक रूप से वितरित फाइटोफ्थोरा प्रजातियों में से एक है, जिसमें लगभग 1000 मेजबान प्रजातियां हैं। रोगज़नक़ी के लिए जिम्मेदार आणविक तंत्र के बारे में ज्ञान इस रोगज़नक़ के सहयोगी रोगों से निपटने के लिए एक महत्वपूर्ण उपकरण है। पी. सिनामोमी में साइटोस्केलेटन गठन में भाग लेने वाले act1, act2 और tub1 जीन के पूर्ण ओपन रीडिंग फ़्रेम (ORF) उच्च दक्षता वाले थर्मल एसिमेट्रिक इंटरलेस्ड (HE-TAIL) पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन (PCR) द्वारा प्राप्त किए गए थे। act1 जीन में 1128 bp ORF शामिल है, जो 375 अमीनो एसिड (aa) और 41,972 kDa के एक अनुमानित प्रोटीन को एन्कोड करता है। act2 ORF में 1083 bp शामिल है और यह 360 aa और 40,237 kDa के अनुमानित प्रोटीन को एनकोड करता है। tub1 की कुल लंबाई 2263 bp है और यह 49.911 kDa के आणविक भार के साथ 453 aa प्रोटीन को एनकोड करता है। बायोइनफॉरमैटिक्स विश्लेषण से पता चलता है कि actin1 फाइटोफ्थोरा इन्फेस्टान्स, फाइटोफ्थोरा मेगास्पर्मा और फाइटोफ्थोरा मेलोनिस के act1 जीन के लिए ऑर्थोलॉग है; actin2 P. इन्फेस्टान्स, फाइटोफ्थोरा ब्रासिका, P. मेलोनिस और पाइथियम स्प्लेंडेंस के act2 जीन के लिए ऑर्थोलॉग है और tubulin1 P. इन्फेस्टान्स और P. कैप्सिसी α- ट्यूबुलिन जीन के लिए उच्चतम ऑर्थोलॉजी दिखाता है ।
तीनों संभावित प्रोटीनों की विश्लेषित 3D संरचना से स्थानिक संरचना का पता चला, जो एक्स-रे विवर्तन द्वारा प्राप्त ऑर्थोलॉगस प्रोटीनों के लिए वर्णित संरचना के काफी समान थी।