जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

केडीडी प्रक्रिया में इंटरैक्टिव नेटवर्क अन्वेषण, कॉर्न फिजीवायरस की जनसंख्या परिवर्तनशीलता के अध्ययन में योगदान

मारियो एलेजांद्रो गार्सिया, मारिया डे ला पाज़ जिमेनेज़ पेक्की, जुआन बॉतिस्ता कैब्राल, एड्रियन नीटो कैस्टिलो और इरमा ग्रेसिएला लगुना

एक ही प्रजाति के व्यक्तियों की आनुवंशिक परिवर्तनशीलता का अध्ययन उन नेटवर्क के माध्यम से किया जा सकता है जो उनके बीच आनुवंशिक दूरियों का प्रतिनिधित्व करते हैं। हमने माल डे रियो कुआर्टो वायरस (MRCV) के मामले का अध्ययन किया, विभिन्न व्यक्तियों के जीनोम प्रोफाइल के बीच दूरी के माप को परिभाषित किया और हैप्लोटाइप का एक नेटवर्क बनाया। नेटवर्क के टोपोलॉजिकल गुणों का विश्लेषण किया गया और इसे दो आयामों में जांचा गया, जिससे स्पेस-टाइम वातावरण बना। जांच से यह अवलोकन हुआ कि, पहले फसल वर्षों में, हैप्लोटाइप की संख्या और उनके बीच की दूरी बाद की फसलों की तुलना में अधिक थी। प्रत्येक वातावरण के लिए एक परिवर्तनशीलता संकेतक की गणना की गई और इसकी अपेक्षित मूल्य के साथ तुलना की गई, जिससे जांच के दौरान किए गए अवलोकन की पुष्टि हुई और निष्कर्ष निकला कि फसल वर्ष 1996-97 के दौरान महामारी होने के बाद वायरस की परिवर्तनशीलता कम हो गई। हैप्लोटाइप नेटवर्क के माध्यम से MRCV की परिवर्तनशीलता का विश्लेषण प्रस्तुत किया गया है। हम इस उपकरण के उपयोग का प्रस्ताव करते हैं, जो KDD प्रक्रियाओं में असामान्य है, जो एक नया दृष्टिकोण लाता है जो ज्ञान प्रतिनिधित्व, संरचित डेटा मॉडलिंग, विज़ुअलाइज़ेशन, अन्वेषण और इंटरैक्टिव खोज की अवधारणाओं को शामिल करता है।
केडीडी प्रक्रिया में इस मामले का मुख्य योगदान नेटवर्कों के इंटरैक्टिव अन्वेषण का प्रस्ताव है, जो विश्लेषण के लिए सहज और आसान साबित हुआ।