जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

मक्का में प्राकृतिक प्रतिरोध-संबंधित मैक्रोफेज प्रोटीन ( एनआरएएमपी ) जीन परिवार के सूखे तनाव की प्रतिक्रिया में सिलिको कार्यात्मक भविष्यवाणी और अभिव्यक्ति विश्लेषण

मोहम्मद गोलम रब्बी, मोहम्मद मुस्तफ़ा कमाल, मोहम्मद साकिब हसन, मोहम्मद मोसब्बीर हुसैन, मोहम्मद नुमान इस्लाम*

प्राकृतिक प्रतिरोध-संबद्ध मैक्रोफेज प्रोटीन ( एनआरएएमपी ) पौधों में धातु होमियोस्टेसिस बनाए रखने के लिए धातु संक्रमण ट्रांसपोर्टर के रूप में कार्य करते हैं। मक्का एनआरएएमपी की जीनोम-व्यापी पहचान और कार्यात्मक भविष्यवाणी का अभी तक अध्ययन नहीं किया गया है। जीनोम-व्यापी विश्लेषण ने मक्का में 29.08 ( ZmNRAMP2 ) से 63.20 ( ZmNRAMP5 ) केडीए के आणविक भार वाले सात (ZmNRAMP1, ZmNRAMP2, ZmNRAMP3, ZmNRAMP4, ZmNRAMP5, ZmNRAMP6, ZmNRAMP7 ) प्रोटीन की पहचान की। ZmNRAMP1 और ZmNRAMP3 को छोड़कर , सभी ZmNRAMPs आवश्यक प्रोटीन हैं (7 से अधिक आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु)। ZmNRAMPs में इंट्रॉन की संख्या 1 से 13 तक होती है सभी प्रोटीनों ने कई रूपांकनों (6 से 10 तक) को दर्शाया जो मक्का और अरेबिडोप्सिस के बीच समूहों में सुसंगत थे। हमने ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन, सीआईएस-रेगुलेटरी एलिमेंट्स, क्रोमोसोमल मैपिंग और जीन ऑन्टोलॉजी एनोटेशन भी किया, जिससे महत्वपूर्ण कार्यात्मक विशेषताओं का पता चला। वनस्पति और प्रजनन ऊतकों में ZmNRAMPs ( ZmNRAMP1, ZmNRAMP2, और ZmNRAMP4 ) की अभिव्यक्ति में उल्लेखनीय वृद्धि भारी धातु अवशोषण, परिवहन और होमोस्टैसिस में एक आवश्यक भूमिका निभा सकती है। सूखे के तनाव के दौरान, cc ( ZmNRAMP1, ZmNRAMP2, ZmNRAMP4, और ZmNRAMP7 ) का महत्वपूर्ण अपरेगुलेशन मक्का में सूखा सहिष्णुता या अनुकूलन में भूमिका निभा सकता है।