जर्नल ऑफ माइक्रोबियल एंड बायोकेमिकल टेक्नोलॉजी

अमूर्त

वर्चुअल स्क्रीनिंग दृष्टिकोण द्वारा नवीन हेपेटाइटिस सी वायरस NS3-4A प्रोटीज अवरोधकों की पहचान

अनीश कुमार, रश्मी गुप्ता, कनिका वर्मा, क्षितिजा अय्यर, शांति वी और के रामनाथन

हेपेटाइटिस सी वायरस (HCV) दुनिया भर में सिरोसिस और लीवर कैंसर का एक प्रमुख कारण है। HCV की प्रतिकृति और वायरल पॉलीप्रोटीन परिपक्वता पॉलीप्रोटीन अग्रदूत के 10 वायरल प्रोटीन में विभाजन पर महत्वपूर्ण रूप से निर्भर करती है। NS3-4A सेरीन प्रोटीज पांच में से चार जंक्शनों पर पॉलीप्रोटीन के गैर-संरचनात्मक क्षेत्र को विभाजित करता है, इस प्रकार यह एंटीवायरल अवरोधकों के विकास के लिए एक आशाजनक लक्ष्य है। नैदानिक ​​परीक्षण में HCV NS3/4A प्रोटीज के कई अवरोधक हैं और सुधार वायरल संक्रमण दर में महत्वपूर्ण कमी का संकेत देते हैं। हालाँकि, अधिकांश PI उपचार के दौरान प्रतिरोध से जुड़े वेरिएंट विकसित करते हैं और एक या दो HCV जीनोटाइप तक सीमित होते हैं। दूसरी पीढ़ी का PI, MK-5172, एकमात्र अपवाद है, जो पहली पीढ़ी के PI के प्रतिरोध से जुड़े अधिकांश वेरिएंट को शक्तिशाली रूप से बाधित करता है और पैन-जीनोटाइपिक है। इस अध्ययन में, हमने सबसे शक्तिशाली सिद्ध प्रोटीज अवरोधक, MK-5172 का उपयोग करके समानता खोज के आधार पर शक्तिशाली लीड यौगिक (यौगिक) की जांच की। हमने लीड जैसे अणुओं की पहचान करने के लिए NCBI में उपलब्ध PubChem डेटाबेस का उपयोग करके वर्चुअल स्क्रीनिंग तकनीक का प्रदर्शन किया है। डेटाबेस ने 95% समानता खोज के लिए 32 हिट दिए हैं और स्क्रीनिंग यौगिकों के लिए फार्माकोकाइनेटिक विश्लेषण (ADME) किया गया था। इस संरचना आधारित दवा डिजाइन ने तीन प्रमुख यौगिकों की पहचान की जो NS3/4A प्रोटीज के खिलाफ बेहतर काम कर सकते हैं।