जैव रसायन एवं विश्लेषणात्मक जैव रसायन

अमूर्त

मैक्रोमॉलीक्यूलर रिफाइनमेंट में सेलेनोमेथियोनाइन का प्रबंधन

जारोस्लाव ब्लास्ज़िक

प्रोटीन डेटा बैंक में, हम एक्स-रे संरचनाएँ पा सकते हैं जो सेलेनियम-व्युत्पन्न प्रोटीन से निर्धारित की गई थीं, लेकिन जमा किए गए निर्देशांक, हमारे आश्चर्य के लिए, मूल मेथियोनीन होते हैं। समस्या संभवतः रासायनिक प्रतिक्रिया के दौरान मूल मेथियोनीन के सेलेनोमेथियोनीन के साथ पूर्ण प्रतिस्थापन न होने के कारण है। जब क्रिस्टल ऐसे नमूने से बढ़ता है, और बाद में एक्स-रे विश्लेषण के अधीन होता है, तो यह मूल सल्फर की आंशिक उपस्थिति दिखा सकता है। यह पेपर सेलेनोमेथियोनीन के शोधन को संभालने के तरीके पर चर्चा में एक आवाज़ है। इस कार्य का उद्देश्य यह बताना है कि सेलेनोमेथियोनीन को मूल मेथियोनीन के रूप में शुद्ध रूप से परिष्कृत क्यों नहीं किया जा सकता है, विशेष रूप से उच्च रिज़ॉल्यूशन पर निर्धारित मैक्रोमोलिकुलर संरचनाओं में। यह महत्वपूर्ण है क्योंकि सेलेनियम और सल्फर अलग-अलग रासायनिक तत्व हैं। सही परमाणु प्रकार के शोधन के महत्व को समझाने के लिए, लेखक मुख्य रूप से सल्फर या सेलेनियम युक्त अपनी पहले से रिपोर्ट की गई छोटी कार्बनिक संरचनाओं से एकत्रित साक्ष्य प्रदान करता है। लेखक इस बात पर जोर देता है कि एक्सरे संरचनाएँ, जिनमें सेलेनियम होता है, कभी भी उनके सल्फर युक्त एनालॉग के समान नहीं होती हैं। वे कम से कम संबंधित बंधन लंबाई में भिन्न होते हैं। दो सार्वजनिक रूप से उपलब्ध एक्स-रे संरचनाओं को फिर से परिष्कृत किया गया है, एक छोटा अणु और एक मैक्रोमोलेक्यूल, जिसमें परमाणु प्रकार को जानबूझकर बदल दिया गया था। रासायनिक रूप से गलत परमाणु प्रकार के शोधन से परमाणु विस्थापन मापदंडों का गैर-प्राकृतिक व्यवहार प्राप्त हुआ। लेखक ने निष्कर्ष निकाला है कि जिन संरचनाओं में गलत परमाणु प्रकार होते हैं वे प्रयोगात्मक डेटा का प्रतिनिधित्व नहीं कर सकते हैं लेकिन केवल मॉडल के रूप में काम कर सकते हैं। पीडीबी में ऐसे उदाहरण हैं, जो दिखाते हैं कि पूरी तरह से सी-मेट व्युत्पन्न प्रोटीन में सेलेनोमेथियोनाइन को मनमाने ढंग से ग्रहण किए गए आंशिक, 100% से कम, अधिभोग के साथ परिष्कृत किया जा सकता है। इसने लेखक को ऊपर उल्लिखित सी-मेट संरचना के विभिन्न पुनः शोधन करने के लिए प्रेरित किया, जिसमें निर्देशांक में एस परमाणु शामिल थे