जीवविज्ञान और चिकित्सा

अमूर्त

कोलोरेक्टल कैंसर से जुड़े डीएनए मिथाइलेशन मार्करों का GLAD-PCR परीक्षण

एलेक्सी ए एवदोकिमोव, नीना ए नेतेसोवा, नतालिया ए स्मेटनिकोवा, मूरत ए अब्दुरैशिटोव, एलेक्जेंडर जी अकीशेव, बोरिस एस मालिशेव, एवगेनिया एस डेविडोविच, व्लादिमीर वी फेडोटोव, विटाली वी कुजनेत्सोव, यूरी डी एर्मोलेव, एंड्री बी कार्पोव, एलेक्सी ई सोजोनोव, रविल एम तहौव और सर्गेई ख डिग्टिएरेव

जीन विनियामक क्षेत्रों के हाइपरमेथिलेशन को कई कैंसर रोगों के लिए प्रलेखित किया गया है। कैंसर कोशिकाओं में इस तरह के एक असामान्य डीएनए मिथाइलेशन को डीएनए मेथिलट्रांसफेरेज़ Dnmt3a और Dnmt3b द्वारा उत्प्रेरित किया जाता है, जो मुख्य रूप से RCGY अनुक्रमों को पहचानते हैं और R(5mC)GY साइट्स के गठन के साथ मिथाइलेट करते हैं। हाल ही में, एक नए मिथाइल-निर्देशित डीएनए एंडोन्यूक्लिअस GlaI के आधार पर, हमने एक GLAD-PCR परख विकसित की, जो जीनोमिक डीएनए की एक निर्धारित स्थिति में R(5mC)GY साइट का निर्धारण करने की अनुमति देती है। इस काम में हमने कोलोरेक्टल कैंसर (CRC) से जुड़े कुछ डाउनरेगुलेटेड जीन के विनियामक क्षेत्रों में मिथाइलेटेड RCGY साइट्स की पहचान के लिए GLAD-PCR परख लागू की। इस सूची में ADHFE1, ALX4, CNRIP1, EID3, ELMO1, ESR1, FBN1, HLTF, LAMA1, NEUROG1, NGFR, RARB, RXRG, RYR2, SDC2, SEPT9, SFRP2, SOCS3, SOX17, THBD, TMEFF2, UCHL1, और VIM जीन शामिल हैं। इनमें से कुछ जीन के विनियामक क्षेत्रों के भीतर चयनित RCGY साइटों का GLAD-PCR विश्लेषण ट्यूमर DNA में CRC का पता लगाने की अपेक्षाकृत उच्च संवेदनशीलता और विशिष्टता के साथ एक अच्छी रोगनिदान क्षमता प्रदर्शित करता है।