जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

मानव बृहदान्त्र और पित्ताशय से पृथक किए गए पांच कोगुलेज़-नेगेटिव स्टैफिलोकोसी (सीएनएस) का जीनोम माइनिंग और तुलनात्मक जीनोमिक विश्लेषण

रामेसन गिरीश नायर, गुरविंदर कौर, इंदु खत्री, नितिन कुमार सिंह, सुदीप कुमार मौर्य, श्रीकृष्ण सुब्रमण्यम, अरुणांशु बेहरा, दिव्या दहिया, जावेद एन अग्रेवाला और शनमुगम मयिलराज

कोगुलेज़-नेगेटिव स्टैफिलोकोसी (सीएनएस) मनुष्यों में एंडोकार्डिटिस और मूत्र पथ के संक्रमण (यूटीआई) जैसे विभिन्न प्रकार के संक्रमणों का कारण बनते हैं। आश्चर्यजनक रूप से, विशेष रूप से मानव मूल के सीएनएस के खिलाफ साहित्य में जीनोम विश्लेषण डेटा की कमी है। इसके मद्देनजर, हमने जीनोम माइनिंग और सीएनएस स्ट्रेन स्टैफिलोकोकस कोहनी सबस्प कोहनी स्ट्रेन GM22B2, स्टैफिलोकोकस इक्वोरम सबस्प स्ट्रेन इक्वोरम G8HB1, स्टैफिलोकोकस पेस्टुरी स्ट्रेन BAB3 को पित्ताशय से अलग करके और स्टैफिलोकोकस हेमोलिटिकस स्ट्रेन 1HT3, स्टैफिलोकोकस वार्नरी स्ट्रेन 1DB1 को कोलन से अलग करके तुलनात्मक जीनोमिक विश्लेषण किया। हमने सीएनएस स्ट्रेन में 29% साझा विषाणु निर्धारकों की पहचान की जिसमें एंटीबायोटिक्स और विषाक्त यौगिकों, बैक्टीरियोसिन और राइबोसोमली संश्लेषित पेप्टाइड्स, आसंजन, आक्रमण, इंट्रासेल्युलर प्रतिरोध, प्रोफेज क्षेत्र, रोगजनकता द्वीप शामिल थे। हमारे उपभेदों में आसंजन, नकारात्मक प्रतिलेखन विनियमन, तांबे और कैडमियम के प्रति प्रतिरोध, फेज परिपक्वता में शामिल 10 अद्वितीय विषाणु कारक भी मौजूद थे। जीनोम समरूपता, आकार और जी + सी सामग्री की तुलना करने के अलावा, हमने सीएनएस उपभेदों में 10 अलग-अलग CRISPR-cas जीन की उपस्थिति भी दिखाई। इसके अलावा, KAAS आधारित एनोटेशन ने मानव रोगों में शामिल विभिन्न मार्गों में सीएनएस जीन की उपस्थिति का खुलासा किया। निष्कर्ष में, यह अध्ययन दो अलग-अलग शारीरिक अंगों से अलग किए गए सीएनएस के रोगजनन विज्ञान को उजागर करने का पहला प्रयास है और स्वास्थ्य सेवा क्षेत्र के उभरते रोगजनकों के रूप में सीएनएस के महत्व पर प्रकाश डालता है।