कार्सिनोजेनेसिस और उत्परिवर्तन जर्नल

अमूर्त

कोलन रेक्टल कैंसर ट्यूमर कोशिकाओं के जीन अभिव्यक्ति मेटा-विश्लेषण से ट्यूमरोजेनेसिस से जुड़े जीन का पता चलता है

रुत्वी वाजा

पृष्ठभूमि: हर साल, 12 मिलियन से अधिक लोगों में कोलोरेक्टल कैंसर (सीआरसी) का निदान किया जाता है, और 600,000 से अधिक लोग इससे मर जाते हैं, जिससे यह कैंसर का दूसरा सबसे घातक रूप बन जाता है। यह कार्य सीआरसी और अन्य ग्रंथि संबंधी ट्यूमर नमूनों में विभेदक जीन अभिव्यक्ति का विश्लेषण करता है ताकि सीआरसी ट्यूमरोजेनेसिस के विकास में संभावित रूप से योगदान देने वाले अभिव्यक्ति परिवर्तनों की पहचान की जा सके।

विधियाँ: यह कार्य चार CRC ट्यूमर और 10 अन्य ग्रंथि ट्यूमर का प्रतिनिधित्व करने वाले 13 जीन हस्ताक्षरों को परिभाषित करता है जो मूल रूप से कोलोनिक हैं। जीन सेट संवर्धन विश्लेषण (GSEA) का उपयोग दो CRC हस्ताक्षरों का उपयोग करके GSEA-पहचाने गए अग्रणी-किनारे जीन से सकारात्मक और नकारात्मक CRC जीन पैनल को परिभाषित करने के लिए किया जाता है। फिर GSEA का उपयोग दो स्वतंत्र CRC जीन हस्ताक्षरों में CRC पैनलों के संवर्धन और अग्रणी-किनारे जीन सदस्यता को सत्यापित करने के लिए किया जाता है। फिर विश्लेषण को चार व्यक्तिगत और 10 ग्रंथि ट्यूमर हस्ताक्षरों तक बढ़ाया जाता है। CRC ट्यूमरोजेनेसिस से सबसे अधिक जुड़े जीनों का अनुमान GSEA-पहचाने गए प्रमुख-किनारों की हस्ताक्षरों में प्रतिच्छेदन सदस्यता द्वारा लगाया जाता है।

परिणाम: CRC जीन पहचान हस्ताक्षरों के बीच महत्वपूर्ण संवर्धन देखा गया है, जिससे सकारात्मक (55 जीन) और नकारात्मक (77 जीन) CRC पैनल परिभाषित किए गए हैं। CRC जीन पैनल और सत्यापन हस्ताक्षरों के बीच गैर-यादृच्छिक महत्वपूर्ण संवर्धन देखा गया है, जिसमें से 54 अधिक और 72 कम-अभिव्यक्त जीन अग्रणी-किनारों पर साझा किए गए हैं। अन्य ग्रंथि ट्यूमर नमूनों को व्यक्तिगत रूप से और CRC के साथ संयोजन में विचार करते हुए, इन हस्ताक्षरों में महत्वपूर्ण गैर-यादृच्छिक संवर्धन देखा गया है। CRC पैनल से आठ विलेय वाहक परिवार जीन जैसे (SLC25A32, SLC22A3, SLC25A20, SLC36A1, SLC26A3, SLC9A2, SLC4A4 और SLC26A2) सभी जीन हस्ताक्षरों के अग्रणी-किनारों पर समान रूप से साझा किए गए, चाहे कोलोनिक ट्यूमर का प्रकार कुछ भी हो।

निष्कर्ष: यह मेटा-विश्लेषण सीआरसी ट्यूमरोजेनेसिस की प्रक्रिया से जुड़े जीन अभिव्यक्ति परिवर्तनों की पहचान करता है। ये परिवर्तन सीआरसी रोगियों के लिए उपलब्ध चिकित्सीय उपचार विकसित करने में योगदान दे सकते हैं।