जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

मेजबान जीनों का जीन अभिव्यक्ति स्तर और जीन सेट संवर्धन विश्लेषण

योसुके कोंडो, सतोरू मियाज़ाकी

जीनोम-वाइड विश्लेषण से पता चला है कि गैर-प्रोटीन-कोडिंग आरएनए (एनसीआरएनए) हैं जो प्रोटीन-कोडिंग जीन के इंट्रॉनिक क्षेत्रों पर स्थानीयकृत हैं। इंट्रॉनिक एनसीआरएनए प्रोटीन-कोडिंग जीन के इंट्रॉन में होस्ट किए जाते हैं जिन्हें होस्ट जीन कहा जाता है। हमारे पिछले अध्ययन ने इंट्रॉनिक एनसीआरएनए जीन और होस्ट जीन की जीनोमिक विशेषताओं की रिपोर्ट की। हालाँकि, होस्ट जीन की ट्रांसक्रिप्टोमिक विशेषताओं की जाँच नहीं की गई है। यहाँ हम होस्ट जीन के जीन अभिव्यक्ति स्तर के विश्लेषण की रिपोर्ट करते हैं और होस्ट जीन के जैविक कार्यों की जाँच करते हैं। हमारे परिणामों से पता चला है कि होस्ट जीन के जीन अभिव्यक्ति स्तर गैर-होस्ट जीन की तुलना में अधिक होते हैं। मानव और माउस के बीच ऑर्थोलॉगस होस्ट जीन में गैर-होस्ट ऑर्थोलॉगस जीन की तुलना में अधिक संरक्षित अभिव्यक्ति स्तर होते हैं। और उच्च अभिव्यक्ति स्तर वाले होस्ट जीन में तंत्रिका तंत्र, जीन अभिव्यक्ति, प्रोटीन संशोधन और साइटोस्केलेटन शामिल होते हैं जबकि कम अभिव्यक्ति स्तर वाले होस्ट जीन में ज़्यादातर कोई समृद्ध जैविक कार्य नहीं होते हैं। ये परिणाम बताते हैं कि होस्ट जीन में विशिष्ट ट्रांसक्रिप्ट मात्रा और जैविक कार्य होते हैं। विशेषताएँ होस्ट जीन अभिव्यक्ति के विनियामक तरीकों के आगे के विश्लेषण के लिए उपयोगी हो सकती हैं।