कार्सिनोजेनेसिस और उत्परिवर्तन जर्नल

अमूर्त

15q21 क्षेत्र की बारीक मैपिंग फॉलिक्युलर और फैले हुए बड़े बी-सेल लिम्फोमा के लिम्फोजेनेसिस में TP53BP1 और B2M को दर्शाती है

अया-बोनिला कार्लोस, कैमिलेरी एमिली, बेंटन माइल्स, हॉप्ट लारिसा एम, मार्ल्टन पाउला, ली रॉड ए, गांधी माहेर के और ग्रिफिथ्स लिन आर

पृष्ठभूमि और उद्देश्य: फॉलिक्युलर लिंफोमा (FL) और डिफ्यूज लार्ज बी-सेल लिंफोमा (DLBCL) से पीड़ित मामलों में सामान्य परिवर्तनों की खोज पर ध्यान केंद्रित करने वाले हाल के अध्ययनों ने 15q21 क्षेत्र को लक्षित करते हुए हेटेरोज़ायगोसिटी (LOH) की हानि और विलोपन की घटनाओं की सूचना दी है, जो FL और DLBCL के लिम्फोजेनेसिस में इस क्षेत्र की प्रासंगिकता को दर्शाता है। यहां, हमने पहचाने गए LOH और कॉपी-लॉस घटनाओं का अध्ययन करके इस क्षेत्र की आनुवंशिक संरचना की जांच की और FL और DLBCL के लिम्फोजेनेसिस में इस क्षेत्र की जांच की। तरीके: कॉपी संख्या भिन्नता (CNV) और FL (n=21) और DLBCL (n=21) मामलों के उच्च रिज़ॉल्यूशन LOH विश्लेषण से डेटा का उपयोग करके 15q15.1 और 15q21.1 लोकी के बीच जीनोमिक क्षेत्र की बारीक मैपिंग की गई इसके अलावा, 24 FL और 23 DLBCL नमूनों से ट्यूमर डीएनए पर B2M के एक्सॉन 1 और 2 की सीधी अनुक्रमणिका का प्रदर्शन किया गया। परिणाम: LOH और CNV डेटा के एकीकरण ने 7.5 Mb क्षेत्र में फैले 15q21 लोकी पर कॉपी-लॉस परिवर्तनों की पहचान की, जिसमें दो LOH क्षेत्र शामिल हैं, जिन्हें LOH-1 और LOH-2 कहा जाता है। LOH-1 क्षेत्र 3.4 Mb तक फैला हुआ है और इसमें 53 जीन हैं, जिनमें से TP53BP1 (ट्यूमर-प्रोटीन-p53-बाइंडिंग-प्रोटीन-1) और B2M (बीटा-2-माइक्रोग्लोब्युलिन) को क्रमशः DNA डबल स्ट्रैंड ब्रेक (DSB) मरम्मत और प्रतिरक्षा पहचान में उनकी भूमिकाओं के कारण सबसे संभावित लक्ष्य जीन के रूप में पहचाना गया। अभिव्यक्ति विश्लेषण ने LOH के साथ NHL में TP53BP1 के एक महत्वपूर्ण अप-विनियमन का खुलासा किया, लेकिन B2M अभिव्यक्ति में कोई महत्वपूर्ण परिवर्तन नहीं देखा गया। FL और DLBCL में B2M में एक्सॉन 1 और 2 की सीधी अनुक्रमण ने DLBCL से जुड़े दो मोनोएलीलिक माइक्रोडिलीशन की पहचान की। निष्कर्ष: इस अध्ययन ने पहचाना कि 15q21 लोकस के लिए डिलीशन मैपिंग दो LOH क्षेत्रों को कवर करती है। TP53BP1 और B2M जीन के LOH FL और DLBCL ट्यूमरजनन में आम परिवर्तन प्रतीत होते हैं।