एकातेरिना ए कोरोबकोवा
उद्देश्य: साइक्लोफिलिन डी (CypD) के साथ चैपरोनिन HSP60 का बंधन एक ऑन्कोजेनिक मार्ग का प्रतिनिधित्व करता है जो माइटोकॉन्ड्रिया को पारगम्यता संक्रमण छिद्र (PTP) खुलने से रोकता है। इस प्रकार HSP60 को रासायनिक अवरोधकों के डिजाइन के लिए एक आकर्षक लक्ष्य माना जा सकता है। HSP60 संरचना की जटिलता मानक स्क्रीनिंग विधियों के उपयोग को रोकती है। वर्तमान अध्ययन का उद्देश्य विभिन्न HSP60 डोमेन के साथ CypD इंटरैक्शन की गतिशीलता का विश्लेषण करना था। विधि: सरफेस प्लाज़्मोन रेज़ोनेंस (SPR) तकनीक का उपयोग किया गया था। HSP60 के विभिन्न क्षेत्रों में मैप करने वाले एंटीबॉडी को अमीनो-युग्मन रसायन विज्ञान का उपयोग करके CM5 बायोसेंसर चिप पर स्थिर किया गया था। HSP60 को चिप पर विभिन्न एंटीबॉडी से जोड़ा गया था जिसके परिणामस्वरूप प्रोटीन के विभिन्न अभिविन्यास हुए, और HSP60 से इसके बंधन की गतिकी का विश्लेषण किया गया। परिणाम: HSP60-CypD अंतःक्रियाओं के लिए पृथक्करण दर स्थिरांक 5.5 × 10-4 s-1 और 16 × 10-4 s-1 के बीच थे। पृथक्करण संतुलन स्थिरांक 15.8 nM से 43.5 nM तक भिन्न थे। HSP60 के भूमध्यरेखीय डोमेन में अवशेष 50 और 100 के बीच के क्षेत्र को पहचानने वाले एंटीबॉडी ने CypD के साथ इसके जुड़ाव को रोका। निष्कर्ष: SPR तकनीक CypD और HSP60 सबयूनिट के बीच अंतःक्रियाओं के विश्लेषण में सफल साबित हुई। बंधन शक्ति अपेक्षाकृत मजबूत एंटीबॉडी-एंटीजन बंधन के बराबर थी। HSP60 सबयूनिट के भीतर एक विशिष्ट डोमेन के लिए CypD का अधिमान्य बंधन एक आणविक प्रतिपक्षी को डिजाइन करने की संभावना का सुझाव देता है।