जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

बोवाइन मैस्टाइटिस में माइक्रोबायोम संरचना और जीनोमिक कार्यात्मक क्षमता में गतिशील परिवर्तन

एम. नजमुल हक, मुनव्वर सुल्ताना, एम. अनवर हुसैन*

हम पहले से प्रकाशित अध्ययन "बोवाइन मैस्टाइटिस प्रगति और जीनोमिक निर्धारकों के माइक्रोबायोम डायनेमिक्स" पर एक छोटी समीक्षा प्रदान करते हैं, जहां हमने बोवाइन मैस्टाइटिस के विभिन्न पैथोफिजियोलॉजिकल स्थितियों में उनके जीनोमिक कार्यात्मक क्षमताओं द्वारा समर्थित माइक्रोबायोम रचनाओं में संभावित गतिशील परिवर्तनों की सूचना दी। अत्याधुनिक संपूर्ण मेटागेनोम अनुक्रमण (WMS) दृष्टिकोण का उपयोग करते हुए, हमने नैदानिक ​​मैस्टाइटिस (CM), आवर्तक नैदानिक ​​मैस्टाइटिस (RCM), सबक्लिनिकल मैस्टाइटिस (SCM) और स्वस्थ (H) दूध मेटागेनोम (CM>H>RCM>SCM) में माइक्रोबायोम संरचना और प्रचुरता में अलग-अलग भिन्नता की सूचना दी। बैक्टीरिया प्रमुख माइक्रोबियल डोमेन (>99.0% सापेक्ष प्रचुरता) थे, इसके बाद आर्किया और वायरस थे। चार मेटागेनोम में बैक्टीरियोम संरचना में गतिशील परिवर्तन संख्यात्मक रूप से मैस्टाइटिस मेटागेनोम में पहले से अप्रतिबंधित अवसरवादी उपभेदों के 67.19% समावेशन द्वारा हावी थे। इस अध्ययन ने इन मेटाजीनोम में माइक्रोबायोम के अनूठे और साझा वितरण की भी रिपोर्ट की। माइक्रोबायोम संरचना और विविधता के अलावा, अध्ययन ने सीएम, आरसीएम, एससीएम और एच-माइक्रोबायोम में कई विषाणु कारक-संबंधित जीन (वीएफजी) और एंटीबायोटिक प्रतिरोधी जीन (एजीआर) के संबंध की रिपोर्ट की। कार्यात्मक एनोटेशन ने मास्टिटिस के विभिन्न प्रकरणों से संबंधित कई चयापचय मार्गों का पता लगाया। इसलिए, प्रकाशित डेटा से पता चला कि विभिन्न प्रकार के मास्टिटिस में माइक्रोबायोम संरचना में परिवर्तन, वीएफजीएस, एआरजी और जीनोमिक कार्यात्मक क्षमताओं का समवर्ती मूल्यांकन माइक्रोबायोम-आधारित निदान और मास्टिटिस के लिए चिकित्सा विकसित करने में योगदान दे सकता है, और इस बीमारी से होने वाले आर्थिक नुकसान को कम करने पर महत्वपूर्ण प्रभाव डालता है।