जीन प्रौद्योगिकी

अमूर्त

ड्रॉपलेट-डिजिटल पीसीआर बायोमार्कर FcγRIIIa-F158V जीनोटाइप की पहचान के लिए एक तीव्र, सटीक और लागत प्रभावी विधि प्रदान करता है

पॉल ग्रिफिथ, डेविड सन, सारा आर ट्रिट्श, कैरोलीन जोचेम्स, जेम्स एल गुले, जेफरी श्लोम और ज़ियाओलिन वू

नवीन मोनोक्लोनल एंटीबॉडी, टीके और ऑन्कोलिटिक वायरस उपचारों के विकास ने सफलता के संभावित भविष्यवक्ता के रूप में बायोमार्कर के विश्लेषण पर भरोसा किया है। एक अच्छी तरह से अध्ययन किया गया बायोमार्कर CD16/ FcγRIIIa रिसेप्टर अवशेष 158 F/V है। FcγRIIIa लोकस की जीनोटाइपिंग के माध्यम से वेरिएंट की पहचान करना व्यापक रूप से प्रचलित है और आम तौर पर इस्तेमाल की जाने वाली विधियों के साथ अत्यधिक विविधतापूर्ण है जिनमें शामिल हैं: सेंगर अनुक्रमण, फ्लो-साइटोमेट्री, पीसीआर/आरएफएलपी, गोल्डेनगेट (इनफिनियम द्वारा प्रतिस्थापित) और टैकमैन विश्लेषण। जबकि इनमें से प्रत्येक विधि को CD16 FcγRIIIa 158 F/V से संबंधित प्रकाशनों में काफी समर्थन प्राप्त है, लेकिन अधिकांश विधियाँ समय और लागत-कुशल तरीके से होमोजाइगोट्स (जंगली-प्रकार और उत्परिवर्ती) और हेटेरोजाइगोट्स दोनों की पहचान करने में महत्वपूर्ण कमियाँ प्रस्तुत करती हैं। FcγRIIIa-F158V विशिष्ट जांच के साथ ड्रॉपलेट-डिजिटल पीसीआर के उपयोग से जीनोमिक नमूनों में अनुक्रम की प्रत्यक्ष पहचान का उपयोग करके सटीक जीनोटाइपिंग कम औसत लागत और तेज़ टर्नअराउंड पर होती है। यहाँ हम 128 रोगी नमूनों में इल्युमिना अनुक्रमण द्वारा पुष्टि के साथ FcγRIIIa-F158V जीनोटाइप की सटीक पहचान करने के लिए ddPCR के उपयोग को प्रदर्शित करते हैं।