जर्नल ऑफ़ स्टेम सेल रिसर्च एंड थेरेपी

अमूर्त

विभेदक miRNA अभिव्यक्ति मानव कोलोरेक्टल कैंसर में कई कैंसर स्टेम सेल उप-जनसंख्या के उद्भव में योगदान देती है

विक्टोरिया ए. स्टार्क, कैरोलीन ओबी फेसी, लिन एम. ओपडेनेकर, जेरेमी जेड. फील्ड्स, ब्रूस एम. बोमन1

कैंसर चिकित्सा में प्रभावकारिता की कमी का एक कारण ट्यूमर की विविधता है। हम अनुमान लगाते हैं कि ट्यूमर की विविधता कई कैंसर स्टेम सेल (CSC) उप-जनसंख्या के उभरने के कारण उत्पन्न होती है क्योंकि miRNAs CSCs में स्टेम सेल जीन की अभिव्यक्ति को नियंत्रित करते हैं। हमारा लक्ष्य यह निर्धारित करना था कि क्या: i) मानव CRC सेल आबादी में कई CSC उप-जनसंख्या मौजूद हैं, और ii) miRNAs अलग-अलग CSC उप-जनसंख्या में अलग-अलग तरीके से व्यक्त किए जाते हैं। हमने पाया कि HT29 सेल लाइन में कम से कम चार अलग-अलग CSC आबादी (ALDH1, CD166, LGR5, और LRIG1) मौजूद हैं। CSC उप-जनसंख्या को कई स्टेम सेल मार्करों के लिए सह-धुंधलापन का उपयोग करके मात्राबद्ध किया गया, FACS का उपयोग करके अलग किया गया, और नैनोस्ट्रिंग miRNA प्रोफाइलिंग द्वारा विश्लेषण किया गया। प्रत्येक CSC उप-जनसंख्या में miRNA अभिव्यक्ति पैटर्न का विश्लेषण अन्य CSC उप-जनसंख्या में miRNA अभिव्यक्ति पैटर्न के सापेक्ष किया गया। प्रत्येक CSC उप-जनसंख्या में अप-विनियमित miRNAs द्वारा लक्षित किए जाने वाले मैसेंजर RNAs को: 1) जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण का उपयोग करके पहचाना गया, और 2) डेविड कार्यात्मक एनोटेशन विश्लेषण का उपयोग करके उनके पूर्वानुमानित कार्यों के अनुसार वर्गीकृत किया गया। हमने प्रत्येक CSC उप-जनसंख्या में एक अद्वितीय miRNA हस्ताक्षर के साथ कई CSC उप-जनसंख्याएँ पाईं। विशेष रूप से, एक CSC उप-जनसंख्या के भीतर व्यक्त किए गए miRNAs को अन्य CSC उप-जनसंख्याओं को स्थापित करने वाले CSC जीन और मार्गों को लक्षित और डाउन-विनियमित करने के लिए पूर्वानुमानित किया जाता है। इसके अलावा, विभिन्न CSC उप-जनसंख्याओं में miRNAs द्वारा लक्षित किए जाने वाले mRNAs के अलग-अलग सेलुलर कार्यात्मक वर्गीकरण होते हैं। यह कि विभिन्न CSC उप-जनसंख्याएँ miRNAs को व्यक्त करती हैं जो अन्य CSC उप-जनसंख्याओं में व्यक्त CSC जीन को लक्षित करने के लिए पूर्वानुमानित हैं, एक तंत्र प्रदान करता है जो कई CSC उप-जनसंख्याओं, ट्यूमर विषमता और कैंसर थेरेपी प्रतिरोध के सह-अस्तित्व की व्याख्या कर सकता है।