जर्नल ऑफ़ प्लांट पैथोलॉजी एंड माइक्रोबायोलॉजी

अमूर्त

ज़ाइलेला फास्टिडियोसा उपप्रजाति फास्टिडियोसा और ज़ाइलेला फास्टिडियोसा उपप्रजाति मल्टीप्लेक्स का तेजी से पता लगाने और विभेदन के लिए मात्रात्मक वास्तविक समय पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन प्रोटोकॉल का विकास

ब्रिटनी पियर्स, लिसा मोरानो और ब्लेक बेक्सटाइन

जाइलेला फास्टिडिओसा एक ग्राम-नेगेटिव, जाइलम-सीमित, पादप रोगजनक जीवाणु है, जो ग्लासी-विंग्ड शार्पशूटर (होमलोडिस्का विट्रिपेनिस) द्वारा मेजबानों के बीच फैलता है। एक्स. फास्टिडिओसा की कई उप-प्रजातियां पाई जाती हैं, जो कुछ हद तक मेजबान विशिष्टता प्रदर्शित करती हैं। एक्स. फास्टिडिओसा उप-प्रजाति फास्टिडिओसा अंगूर की पियर्स रोग का प्रेरक एजेंट है। एक्स. फास्टिडिओसा उप-प्रजाति मल्टीप्लेक्स और एक्स. फास्टिडिओसा उप-प्रजाति सैंडी सामान्यतः उत्तरी अमेरिका में पाए जाते हैं, लेकिन पियर्स रोग का कारण नहीं बनते हैं। एक्स. फास्टिडिओसा की उपस्थिति निर्धारित करने के लिए तेजी से निदान और इन उप-प्रजातियों का विभेदन पियर्स रोग के प्रभावी प्रबंधन और रोकथाम के लिए आवश्यक है। SYBR ® ग्रीन, ईवा ग्रीन ®, और ताकारा SYBR ग्रीन ® आंशिक गाइरेसबी एम्प्लीकॉन्स, ज़ोट1 जीन एम्प्लीकॉन्स, और पाँच टोनबी एम्प्लीकॉन्स के पिघल वक्र विश्लेषण का स्थिरता और गुणवत्ता के लिए मूल्यांकन किया गया। ताकमैन ® और मॉलिक्यूलर बीकन ® हाइब्रिडाइजेशन जांच पर आधारित डायग्नोस्टिक प्रोटोकॉल को ज़ोट1 जीन में एक्स. फास्टिडियोसा उपप्रजाति मल्टीप्लेक्स प्रविष्टि पर जोर देने के साथ विकसित किया गया था। हमने पाया कि SYBR ® ग्रीन और ताकमैन ® आधारित डायग्नोस्टिक प्रोटोकॉल ने एक्स. फास्टिडियोसा उप-प्रजातियों के सटीक और सुसंगत भेदभाव के लिए आवश्यक समाधान प्रदान नहीं किया। मॉलिक्यूलर बीकन ® जांच का उपयोग करके हमने जो डायग्नोस्टिक प्रोटोकॉल विकसित किए हैं, वे एक्स. फास्टिडियोसा उप-प्रजातियों के अत्यधिक विशिष्ट और विश्वसनीय भेदभाव की अनुमति देते हैं, यहां तक ​​कि उन मामलों में भी जहां उप-प्रजातियां घोल में मिश्रित थीं। ये नई विधियां अधिक विश्वसनीय प्रोटोकॉल प्रदान करती हैं, जिसके द्वारा प्रयोगशाला अध्ययन और नमूना निदान के प्रयोजनों के लिए एक्स. फास्टिडिओसा की उप-प्रजातियों की तेजी से पहचान की जा सकती है।