जर्नल ऑफ़ प्लांट पैथोलॉजी एंड माइक्रोबायोलॉजी

अमूर्त

फ्यूजेरियम ऑक्सीस्पोरम एफ. प्रजाति लाइकोपर्सिकी का तेजी से पता लगाने के लिए लूप-मध्यस्थ आइसोथर्मल प्रवर्धन परख का विकास और अनुप्रयोग

मोहम्मद अमीन अलमासी, सैयद मोहम्मद होसैनी देहाबादी, अबूबक्र मोरादी, ज़हरा इफ़्तेख़ारी, मेहदी अघापुर ओजाघकांडी और सईदे अघाई

पहली बार एक विश्वसनीय और तेज़ रोगज़नक़ पहचान प्रोटोकॉल विकसित किया गया था, जो फ्यूजेरियम ऑक्सीस्पोरम एफ.एस.पी. लाइकोपर्सिकी का पता लगाने के लिए कलरिमेट्रिक लूप-मध्यस्थ आइसोथर्मल एम्पलीफिकेशन (एलएएमपी) का उपयोग करता है। इस संबंध में, सभी छह एलएएमपी प्राइमर (यानी एफ3, बी3, एफआईपी, बीआईपी, एलएफ और एलबी), पीसीआर प्राइमर (एफ और आर) के साथ मिलकर कवक जीनोम के 28 एस राइबोसोमल आरएनए जीन (जेनबैंक एक्सेसन नंबर: एचएम057281.1) के आधार पर डिज़ाइन किए गए थे। भले ही पीसीआर और एलएएमपी परख सकारात्मक संक्रमित नमूनों का सफलतापूर्वक पता लगा सकते हैं, लेकिन समय, सुरक्षा, लागत और सरलता को देखते हुए, बाद वाला कुल मिलाकर बेहतर था। इसके अलावा, परिणामों ने प्रदर्शित किया कि एलसीएमपी परख पीसीआर की तुलना में 100 गुना संवेदनशील और 4 गुना तेज थी। दिलचस्प बात यह है कि एलएएमपी प्रतिक्रिया डीएनए शुद्धिकरण (प्रत्यक्ष-एलएएमपी) के बिना फ्यूजेरियम ऑक्सीस्पोरम एफ.एस.पी. लाइकोपर्सिकी का सफलतापूर्वक पता लगा सकती है। इस बीच, LAMP उत्पादों का पता लगाने के लिए इस्तेमाल किए जाने वाले छह दृश्य रंगों में से, हाइड्रोक्सीनेफ्थॉल ब्लू, जीनफाइंडरTM और SYBR ग्रीन I, क्रॉस-संदूषण जोखिम को रोकने के लिए, एक बंद ट्यूब-आधारित दृष्टिकोण में लंबे समय तक स्थिर रंग परिवर्तन और चमक पैदा कर सकते हैं। कुल मिलाकर, चूंकि LAMP संवेदनशील, लागत प्रभावी, काफी उपयोगकर्ता के अनुकूल है, और पिछली नैदानिक ​​प्रक्रियाओं, जैसे कि सीरोलॉजिकल विधियों, पीसीआर और अन्य आणविक विधियों की तुलना में अधिक सटीक परिणाम भी उत्पन्न कर सकता है, इसलिए हम तदनुसार इस रंगमिति परख को फ्यूसैरियम ऑक्सीस्पोरम एफ. एसपी. लाइकोपर्सिकी पहचान और संभवतः अन्य कवक-आधारित रोगों के संबंध में एक अत्यधिक विश्वसनीय वैकल्पिक कवक पहचान प्रणाली के रूप में प्रस्तावित करते हैं।