जर्नल ऑफ बायोमोलेक्यूलर रिसर्च एंड थेरेप्यूटिक्स

अमूर्त

[ 11 Ψ 12 (CN 4 )]ScyII और [ 15 Ψ 16 (CN 4 )]ScyII - दो स्काइलोरहिनिन II एनालॉग्स का 2D NMR स्पेक्ट्रोस्कोपी और सैद्धांतिक तरीकों के माध्यम से संरचनात्मक अध्ययन

क्रिज़िस्तोफ़ ब्रज़ोज़ोव्स्की, एमिलिया सिकोरस्का, हन्ना मिक्ज़निकोव्स्का, कटारज़ीना कोनेको, राफ़ास एस्लुसार्ज़, जोलांटा कुमिरस्का, विटोल्ड मोज़्गा, जेसेक ओल्ज़ाक, जानूस ज़ब्रोकी, सिल्विया रोडज़िविक्ज़-मोटोविडो और ज़बिग्न्यू काज़िंस्की

डीएमएसओ-डी6 में स्काइलोरहिनिन II [11Ψ12(CN4])]ScyII और [15Ψ16(CN4)]ScyII के दो एनालॉग्स का एक अनुरूप विश्लेषण किया गया। 2D NMR तकनीक और संयमित आणविक गतिशीलता को लागू किया गया। हमारे पिछले अध्ययनों से पता चला था कि स्काइलोरहिनिन II DMSO-d6 घोल में तीन सीआईएस पेप्टाइड बॉन्ड को अपनाता है। इसके अलावा, इसके दो एनालॉग्स [Aib16] ScyII और [Sar16]ScyII में, हमें सीआईएस पेप्टाइड बॉन्ड ज्यामिति भी मिली। उपरोक्त बातों को ध्यान में रखते हुए, हमने संयमित ScyII एनालॉग्स के व्यापक अनुरूप अध्ययन करने का फैसला किया। ऐसा करने के लिए, हमने अध्ययन किए गए पेप्टाइड्स में से किसी एक में टेट्राज़ोल समूह पेश किया। इन पेप्टाइड्स को Fmoc रसायन विज्ञान का उपयोग करके ठोस-चरण विधि द्वारा संश्लेषित किया गया था। दो एनालॉग के मामले में, निम्नलिखित स्पेक्ट्रा रिकॉर्ड किए गए: TOCSY, NOESY, ROESY, DQF-COSY और तापमान वाले सेट। अंतिम संरचना प्राप्त करने के लिए, हमने XPLOR 3.11 प्रोग्राम में लागू किए गए CHARMM बल क्षेत्र का उपयोग करके संयमित आणविक गतिशीलता सिमुलेशन का प्रदर्शन किया। हमारी गणनाओं के परिणामस्वरूप 10 अनुरूपताओं वाले दो समूह प्राप्त हुए। प्राप्त संरचनाओं की तुलना करते हुए, हमने पाया कि 1,5-प्रतिस्थापित टेट्राज़ोल रिंग का परिचय स्थानीय और वैश्विक दोनों तरह से तीन आयामी संरचना को प्रभावित करता है।