बायोएनर्जेटिक्स: ओपन एक्सेस

अमूर्त

साइट्रिक एसिड चक्र के पहले चरण के एसिटाइल कोएंजाइम ए और सक्सिनिल कोएंजाइम ए के प्रतिस्पर्धी अवरोध में कम्प्यूटेशनल अंतर्दृष्टि

सलाम प्रदीप सिंह और बोलिन कुमार कोंवर

साइट्रिक एसिड चक्र में विभिन्न रासायनिक अभिक्रियाएँ शामिल होती हैं और सभी एरोबिक जीवों को ATP बनाने के लिए इसकी आवश्यकता होती है। वर्तमान जांच साइट्रेट सिंथेस के प्रतिस्पर्धी अवरोध पर केंद्रित है - साइट्रिक एसिड चक्र का पहला चरण। साइट्रेट सिंथेस का ज्ञात प्राकृतिक सब्सट्रेट एसिटाइल कोएंजाइम ए है। प्रारंभ में, पहला सब्सट्रेट ऑक्सालोएसीटेट साइट्रेट सिंथेस से बंधता है जो फिर एंजाइम को अपनी संरचना बदलने के लिए प्रेरित करता है और इस प्रकार एसिटाइल कोएंजाइम ए के लिए एक बंधन स्थल बनाता है। साइट्रेट सिंथेस एंजाइम के सक्सिनिल कोएंजाइम ए द्वारा बाधित होने की कई रिपोर्टें भी हैं जो एसिटाइल कोएंजाइम ए जैसा दिखता है और प्रतिस्पर्धी अवरोधक के रूप में कार्य करता है। इसलिए, वर्तमान जांच इन दो सब्सट्रेट के प्रतिस्पर्धी अवरोध में अंतर्दृष्टि को समझने के लिए साइट्रेट सिंथेस की सक्रिय साइट पर दो सब्सट्रेट अर्थात एसिटाइल कोएंजाइम ए और सक्सिनिल कोएंजाइम ए के आणविक डॉकिंग सिमुलेशन अध्ययनों से संबंधित है। अंत में, हमने प्रतिस्पर्धी अवरोध में योगदान देने वाले परमाणु आवेश को समझने के लिए एसिटाइल कोएंजाइम ए और सक्सिनिल कोएंजाइम ए
का घनत्व कार्यात्मक सिद्धांत (डीएफटी) विश्लेषण भी किया है। आणविक डॉकिंग स्कोर और अंतःक्रिया ऊर्जा ने एसिटाइल कोएंजाइम ए को अनुकूल ऊर्जा के साथ सक्सिनिल कोएंजाइम ए के साथ प्रतिस्पर्धी अवरोध दिखाते हुए दिखाया। साथ ही डीएफटी अध्ययनों ने परमाणु स्तर पर प्रतिस्पर्धी अवरोध के संभावित कारणों का भी खुलासा किया ।