जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

मानव हर्पीज वायरस के कैप्सिड प्रोटीन के लिए दूरी और चरित्र आधारित फाइलोजेनेटिक वृक्ष का कम्प्यूटेशनल विश्लेषण

विपन कुमार सोहपाल, अपूर्बा डे और अमरपाल सिंह

आणविक फायलोजेनेटिक विकासवादी विश्लेषण का एक मूलभूत पहलू है और दूरी एवं चरित्र आधारित विधियों पर निर्भर करता है। इस पत्र में, हम प्रतिस्थापन मॉडल, संपूर्ण खोज के साथ फायलोजेनेटिक मॉडल और एमई तकनीकों का उपयोग करके प्रोटीनों के बीच संबंध का विश्लेषण करने के लिए एचएचवी के वायरल कैप्सिड प्रोटीन की तुलना करते हैं। एनजे और यूपीजीएमए पेड़ों पर आकार पैरामीटर के साथ पॉइसन सुधार के प्रभाव का भी विश्लेषण करते हैं। हम व्यापक कंप्यूटर सिमुलेशन द्वारा दिखाते हैं कि फायलोजेनेटिक पेड़ प्रतिस्थापन दूरी का प्रतिबिंब है। चरित्र आधारित पेड़ से जुड़े मैक्स-मिनी शाखा और बाउंड विधि और मिनिमिनी हेयुरिस्टिक मॉडल और लॉग संभावना के प्रभाव पर भी चर्चा की गई। हमने प्रोटीन संबंधों के पूरी तरह से विश्लेषण के लिए एमएल और एमपी लागू किया।