कोमो कोफ़ी डोनाटीन बेनी, एडजेही डैडी, डेविड कूलिबली एन'गोलो, नथाली गेसेन्ड, सोलेंज एकेए, कोफ़ी मार्सेलिन डीजेई और मिरेइल डोसो
पी. एरुगिनोसा भोजन के ज़हर में शामिल हो सकता है। यह कमज़ोर प्रतिरक्षा वाले लोगों या कमज़ोर लोगों के लिए अत्यधिक रोगजनक है, जिससे रुग्णता और मृत्यु दर की उच्च दर होती है। इस अध्ययन का उद्देश्य स्यूडोमोनास एरुगिनोसा की आणविक पहचान के लिए उपयुक्त फ़ायलोजेनेटिक मार्कर का निर्धारण करना था। न्यूक्लिक एसिड की शुद्धता और सांद्रता स्पेक्ट्रोफोटोमेट्री द्वारा निर्धारित की गई थी। फ़ायलोजेनेटिक मार्कर (16S RNAr, recA, rpoB, STS1) का उपयोग करके संवेदनशीलता प्रतिक्रियाओं और 42 उपभेदों की सीमा का पता लगाने का मूल्यांकन पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन (PCR) द्वारा किया गया था। 230 nm पर 2.1 के औसत अवशोषण के साथ, DNA अर्क का औसत अनुपात (A260/A280) 1.7 है। स्यूडोमोनास एरुगिनोसा संदर्भ स्ट्रेन ATCC 27853 की थ्रेशोल्ड डिटेक्शन rpoB के लिए 0.8 μg/ml और 16S मार्कर RNAr और recA में से प्रत्येक के लिए 7.6 μg/ml थी। सकारात्मक नियंत्रण स्ट्रेन CP2: 1125A और CP3: API की थ्रेशोल्ड डिटेक्शन क्रमशः rpoB जीन का उपयोग करने के लिए 1.2 μg/ml और 0.1 μg/ml थी। recA जीन के लिए यह थ्रेशोल्ड क्रमशः 12.3 μg/ml और 0.9 μg/ml थी। rpoB हाउसकीपिंग जीन की संवेदनशीलता 97.4% थी, उसके बाद recA और 16S RNAr क्रमशः 87.2% और 82.1% थे। rpoB जीन का फ़ायलोजेनेटिक रिज़ॉल्यूशन 16S rRNA और recA जीन की तुलना में अधिक था। ITS1 मार्कर के साथ कोई संवेदनशीलता प्रतिक्रिया नहीं देखी गई। न्यूक्लिक एसिड की गुणवत्ता, शुद्धता और फायलोजेनेटिक मार्कर का चयन पीसीआर विश्लेषण के लिए सबसे महत्वपूर्ण कारकों में से हैं।