जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

अलग-अलग डेटा प्रकारों का संयोजन: प्रोटीन अनुक्रम और प्रोटीन संरचना

केजुए जिया और रॉबर्ट एल. जर्निगन

उच्च-थ्रूपुट, अगली पीढ़ी के अनुक्रमण और अन्य उन्नत प्रौद्योगिकियों के विकास के साथ, बड़ी संख्या में जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल का उत्पादन किया गया है। इनमें से कई प्रोफाइल सार्वजनिक डेटाबेस [1-3] से उपलब्ध हैं। एक चुनौतीपूर्ण शोध समस्या जिसने अतीत में बहुत ध्यान आकर्षित किया है, वह है अभिव्यक्ति डेटा से जीन विनियामक नेटवर्क का अनुमान लगाना। एक जीन विनियामक नेटवर्क को एक निर्देशित ग्राफ द्वारा दर्शाया जाता है, जिसमें नोड्स प्रतिलेखन कारकों या mRNA का प्रतिनिधित्व करते हैं, जिसके किनारे दो नोड्स के बीच ट्रांसक्रिप्शनल विनियामक संबंधों को दर्शाते हैं।