कार्सिनोजेनेसिस और उत्परिवर्तन जर्नल

अमूर्त

कोलोरेक्टल कैंसर में β-प्रोटोकैडेरिन की डाउनरेगुलेटेड अभिव्यक्ति से संबंधित नैदानिक ​​और आणविक विशेषताओं का लक्षण वर्णन

वायब्रिच आर कॉनोसेन लोरेना लोसी, जीन बेनहटर, सिल्विया पिज़िनी, एंड्रिया बिसोगिन, सैंड्रा पेरेंटी, लूसिया मोंटोर्सी, क्लाउडिया जेमेली, टॉमासो ज़ानोक्को-मारानी, ​​पाओला ज़ानोवेलो, फैब्रीज़ियो फेरारीनी, सर्जियो फेरारी, स्टेफ़ानिया बर्तोलुज़ी और एलेक्सिस ग्रांडे

म्यू-प्रोटोकैडेरिन कैडेरिन सुपरफैमिली से संबंधित एक झिल्ली प्रोटीन है जो अन्य सदस्यों की तरह अंतर-कोशिकीय आसंजन और प्रसार निरोध को बढ़ावा देता है। उल्लेखनीय रूप से, ये दोनों ऑन्को-दमनकारी गतिविधियाँ β-कैटेनिन सिग्नलिंग मार्ग को बाधित करने की इसकी क्षमता द्वारा मध्यस्थ होती हैं, जो कि कोलोरेक्टल कैंसर (सीआरसी) में संवैधानिक रूप से सक्रिय होती है और, आश्चर्य की बात नहीं है, इसकी अभिव्यक्ति सीआरसी में उल्लेखनीय डाउन-रेगुलेशन से गुजरती है, हालांकि यह खोज आज तक केवल सीमित रोगियों में ही प्राप्त की गई है। इस आधार पर, हमारे अध्ययन के उद्देश्य थे: (1) सीआरसी रोगियों के एक बड़े समूह में μ-प्रोटोकैडेरिन की डाउन-रेगुलेटेड अभिव्यक्ति की पुष्टि करना; (2) इस प्रोटीन के अभिव्यक्ति स्तरों और रोग के नैदानिक-रोग संबंधी मापदंडों के बीच मौजूद संभावित संबंध का आकलन करना; (3) सीआरसी में होने वाली इसकी अभिव्यक्ति में कमी के अंतर्निहित आणविक तंत्र की पहचान करना। इन मुद्दों को संबोधित करने के लिए, हमने एक डेटाबेस विकसित किया जिसमें एक हज़ार से ज़्यादा CRC अभिव्यक्ति प्रोफ़ाइल शामिल हैं, जिन्हें GEO (जीन एक्सप्रेशन ऑम्निबस) द्वारा पुनर्प्राप्त किया गया और नैदानिक ​​जानकारी का एक महत्वपूर्ण सेट प्रदान किया गया, जिसका बाद में कैडहेरिन जीन का बायोइनफॉरमैटिक विश्लेषण करने के लिए उपयोग किया गया। CRC नमूनों की एक स्वतंत्र श्रृंखला में, बिसल्फ़ाइट पाइरो-सीक्वेंसिंग प्रक्रिया का उपयोग करके μ-प्रोटोकैडहेरिन जीन प्रमोटर का मिथाइलेशन विश्लेषण भी किया गया। प्राप्त परिणामों ने CRC में μ-प्रोटोकैडहेरिन अभिव्यक्ति के डाउन-रेगुलेशन की पुष्टि की, इस परिवर्तन के लिए एक संभावित रोगसूचक भूमिका का सुझाव दिया और इसके जीन के प्रमोटर हाइपर-मेथिलेशन को जिम्मेदार तंत्र के रूप में इंगित किया।