एक्वाकल्चर अनुसंधान एवं विकास जर्नल

अमूर्त

झींगा (पैंडालोप्सिस जैपोनिका) से चिटिन सिंथेस को एनकोड करने वाले सीडीएनए: आणविक लक्षण वर्णन और अभिव्यक्ति विश्लेषण

मोहम्मद हसन उद्दोवाला, आह रान किम, वोन-ग्यू पार्क, ह्युन-वू किम*

क्रस्टेशियन विकास मोल्टिंग के माध्यम से होता है, जो एक्सोस्केलेटन का आवधिक बहाव है। आवधिक मोल्ट चक्र से जुड़े चिटिन चयापचय में शामिल जीन को समझना डेकैपोड क्रस्टेशियन एक्वाकल्चर के विभिन्न अनुप्रयोगों के लिए महत्वपूर्ण है। चिटिन सिंथेस चिटिन बायोसिंथेटिक मार्ग में एक महत्वपूर्ण एंजाइम है जो मोल्टिंग के बाद नए क्यूटिकल के संश्लेषण में एक प्रमुख भूमिका निभाता है। इस अध्ययन में, हमने पीसीआर (पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन)-आधारित क्लोनिंग और बायोइनफॉरमैटिक्स विश्लेषण के संयोजन के माध्यम से पांडालोप्सिस जैपोनिका से चिटिन सिंथेस (PajCHS) को एन्कोड करने वाला एक पूर्ण-लंबाई वाला cDNA अलग किया। पहचाने गए PajCHS में 1525 एमिनो एसिड अवशेषों (175 kDa) के साथ एक ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन को एनकोड किया गया है। कीटों से प्राप्त अन्य सीएचएस से तुलना करने पर पता चला कि PajCHS में तीन डोमेन होते हैं: एन-टर्मिनल डोमेन ए, कैटेलिटिक डोमेन बी और सी-टर्मिनल डोमेन सी। तीन संरक्षित रूपांकन (EDR, QRRRW और SWGTR) भी कैटेलिटिक डोमेन B के भीतर और उसके पास अच्छी तरह से संरक्षित थे, जो यह दर्शाता है कि Paj-CHS कार्यात्मक रूप से सक्रिय है। एन-टर्मिनल और सी-टर्मिनल डोमेन के भीतर ट्रांसमेम्ब्रेन हेलिक्स में भिन्नता ने सुझाव दिया कि प्रत्येक CHS का अभिविन्यास अलग हो सकता है। फाइलोजेनेटिक विश्लेषण ने सुझाव दिया कि PajCHS कीट प्रजातियों से CHS1 समूह के सदस्यों का ऑर्थोलॉग है। हालांकि, ऊतक अभिव्यक्ति प्रोफाइल ने संकेत दिया कि एपिडर्मिस, हेपेटोपैनक्रियास, आंत और गिल PajCHS ट्रांसक्रिप्ट के लिए प्रमुख उत्पादन स्थल थे, जो कीट CHS1 से काफी अलग है। qPCR परिणामों से पता चला कि नेत्र डंठल पृथक्करण और 20 हाइड्रोक्सीसेडीसोन (20E) इंजेक्शन ने PajCHS mRNA के अभिव्यक्ति स्तर को बढ़ा दिया, जिससे पता चलता है कि PajCHS1 की अभिव्यक्ति को अंतर्जात 20E द्वारा नियंत्रित किया जा सकता है।