जीनोमिक्स और प्रोटिओमिक्स में डेटा माइनिंग जर्नल

अमूर्त

घातक मेसोथेलियोमा में सतह संवर्धित लेजर विशोषण आयनीकरण-उड़ान समय व्युत्पन्न किनेसिन बायोमार्कर के सत्यापन का प्रयास किया गया

स्टीफन एम. ब्रिंडले, ब्रायन सी. टूकर, हार्वे आई. पास और ली एस. न्यूमैन

सरफेस-एन्हांस्ड लेजर डिसोर्प्शन/आयनाइजेशन टाइम-ऑफ-फ़्लाइट (SELDI-TOF) मास स्पेक्ट्रोमेट्री शोधकर्ताओं को रोग के बायोमार्कर के लिए प्रोटिओम की खोज करने की अनुमति देती है। पारंपरिक तरीकों का उपयोग करके SELDI-TOF परिणामों को मान्य करने से मिश्रित परिणाम मिले हैं। एस्बेस्टस से संबंधित कैंसर और काइनेसिन परिवार के प्रोटीन, KIF5A और KIF18A के बीच संबंध की पुष्टि करने के प्रयास में रियल-टाइम पीसीआर, एलिसा और वेस्टर्न ब्लॉट परख का उपयोग किया गया। इन प्रोटीनों की पहचान एस्बेस्टस से संबंधित कैंसर वाले रोगियों के सीरम में SELDI-TOF और वर्गीकरण और प्रतिगमन वृक्ष विश्लेषण (CART) का उपयोग करके की गई थी। जब मेसोथेलियल सेल लाइनों को चुनौती देने के लिए अच्छी तरह से पहचाने जाने वाले एस्बेस्टस फाइबर का उपयोग किया गया, तो KIF5A और KIF18A RNA अभिव्यक्ति में मिश्रित परिणाम देखे गए। मेसोथेलियोमा सेल लाइनों बनाम रूपांतरित मेसोथेलियल कोशिकाओं में प्रोटीन के स्तर की तुलना करने वाले वेस्टर्न ब्लॉट विश्लेषण से अनिर्णायक परिणाम प्राप्त हुए, जैसा कि मानव मेसोथेलियोमा और गैर-कैंसरयुक्त पेरिटोनियम के वेस्टर्न ब्लॉट विश्लेषणों से हुआ था जो उन्हीं रोगियों से प्राप्त किए गए थे। इन परिणामों से पता चलता है कि SELDI-TOF CART द्वारा पता लगाए गए किनेसिन परिवार के प्रोटीन घातक मेसोथेलियोमा के लिए बायोमार्कर के रूप में उपयोग किए जाने की संभावना नहीं है।